41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4809 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4809  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  388  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0595881  normal  0.0255133 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4108  hypothetical protein  87.14 
 
 
141 aa  255  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3467  Barstar (barnase inhibitor)  87.14 
 
 
141 aa  255  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.667156  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4860  hypothetical protein  83.57 
 
 
141 aa  248  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316235  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4761  hypothetical protein  84.06 
 
 
139 aa  246  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4072  hypothetical protein  78.57 
 
 
141 aa  236  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5272  Barstar (barnase inhibitor)  73.83 
 
 
159 aa  235  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0095  hypothetical protein  79.41 
 
 
149 aa  226  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6032  hypothetical protein  72.86 
 
 
192 aa  224  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.141829  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0205  hypothetical protein  74.42 
 
 
132 aa  206  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.854944 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3395  Barstar (barnase inhibitor)  66.41 
 
 
186 aa  191  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0011895  hitchhiker  0.0033866 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3914  hypothetical protein  69.53 
 
 
131 aa  190  9e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2602  hypothetical protein  59.44 
 
 
186 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0560  hypothetical protein  64.84 
 
 
187 aa  185  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.269433  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3437  barstar family protein  65.6 
 
 
187 aa  184  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0394  barstar family protein  65.6 
 
 
187 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1254  barstar family protein  65.6 
 
 
187 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443809  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3474  barstar family protein  65.6 
 
 
187 aa  184  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3311  barstar family protein  65.6 
 
 
187 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1191  barstar family protein  65.6 
 
 
195 aa  184  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2765  hypothetical protein  66.41 
 
 
198 aa  184  7e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.475229 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2474  barstar family protein  65.6 
 
 
132 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3472  barstar family protein  65.6 
 
 
195 aa  184  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2752  hypothetical protein  57.05 
 
 
188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.668584 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2845  hypothetical protein  65.62 
 
 
203 aa  182  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525425  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0633  hypothetical protein  57.43 
 
 
187 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0150  hypothetical protein  57.43 
 
 
187 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0601  hypothetical protein  57.43 
 
 
187 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3011  hypothetical protein  64.06 
 
 
207 aa  180  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0534  hypothetical protein  64 
 
 
187 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0558  hypothetical protein  64 
 
 
187 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.567748 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2601  Barstar (barnase inhibitor)  63.28 
 
 
207 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3715  hypothetical protein  56.08 
 
 
187 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.124225 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0225  hypothetical protein  61.72 
 
 
206 aa  169  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2985  hypothetical protein  62.5 
 
 
202 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.678514  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0247  hypothetical protein  60.94 
 
 
182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00391  hypothetical protein  30 
 
 
141 aa  53.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585131  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0632  hypothetical protein  27.78 
 
 
142 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0193289  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2094  hypothetical protein  28.46 
 
 
138 aa  46.2  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.778398  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2183  hypothetical protein  28.46 
 
 
138 aa  45.1  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.55075  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2671  hypothetical protein  28.35 
 
 
137 aa  45.1  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.223099 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>