13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3333 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3333  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  276  7e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2925  hypothetical protein  32.99 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0463  hypothetical protein  32.71 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.541679  hitchhiker  0.0000105052 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1432  hypothetical protein  34.94 
 
 
126 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.594741 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2094  hypothetical protein  33.93 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.778398  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2183  hypothetical protein  33.04 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.55075  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00391  hypothetical protein  32.65 
 
 
141 aa  47  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585131  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4679  hypothetical protein  49.06 
 
 
154 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1167  Barstar (barnase inhibitor)  33.33 
 
 
121 aa  43.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0947  hypothetical protein  37.18 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3011  hypothetical protein  35.29 
 
 
207 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2765  hypothetical protein  32.04 
 
 
198 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.475229 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2671  hypothetical protein  36 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.223099 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>