216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1904 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1904  Glycerate kinase  100 
 
 		 381 aa  745    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0448313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2298  glycerate kinase  94.75 
 
 		 381 aa  657    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1009  glycerate kinase  84.51 
 
 		 381 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516875  normal  0.67759 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1347  glycerate kinase  80.74 
 
 		 381 aa  547  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.067363  normal  0.0868647 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5226  glycerate kinase  79.16 
 
 		 381 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6154  glycerate kinase  78.63 
 
 		 381 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1925  glycerate kinase  78.63 
 
 		 381 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1948  glycerate kinase  77.84 
 
 		 381 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0679177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1913  glycerate kinase  77.43 
 
 		 381 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.4386  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1843  glycerate kinase  77.31 
 
 		 381 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250112  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2327  glycerate kinase  72.32 
 
 		 389 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.118083  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2484  glycerate kinase 1  72.97 
 
 		 387 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2368  glycerate kinase  72.97 
 
 		 387 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1468  glycerate kinase 1  72.97 
 
 		 387 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1961  glycerate kinase 1  72.75 
 
 		 380 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3344  glycerate kinase 1  72.75 
 
 		 380 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1235  glycerate kinase 1  72.75 
 
 		 380 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.338815  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2117  glycerate kinase 1  72.7 
 
 		 518 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  46.67 
 
 		 379 aa  268  8e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  49.74 
 
 		 380 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  46.49 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  47.47 
 
 		 379 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  46.22 
 
 		 379 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  46.93 
 
 		 379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  46.41 
 
 		 381 aa  252  9.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  47.92 
 
 		 394 aa  248  9e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  48.03 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  48.03 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  48.03 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2538  glycerate kinase  46.67 
 
 		 379 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2292  glycerate kinase  48.58 
 
 		 389 aa  248  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  48.27 
 
 		 381 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  46.63 
 
 		 381 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  43.09 
 
 		 381 aa  237  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  47.47 
 
 		 378 aa  232  7.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  48.17 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  43.58 
 
 		 382 aa  229  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  42.78 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  40.55 
 
 		 380 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3291  Glycerate kinase  41.71 
 
 		 380 aa  224  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000409322  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  44.75 
 
 		 389 aa  222  7e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0348  glycerate kinase  37.9 
 
 		 378 aa  222  9e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  39.73 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  44.34 
 
 		 378 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  38.02 
 
 		 392 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  38.73 
 
 		 379 aa  220  3.9999999999999997e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  46.04 
 
 		 388 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  44.04 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26280  glycerate kinase  43.99 
 
 		 385 aa  217  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0355581 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  40.17 
 
 		 395 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  44.32 
 
 		 381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  43.47 
 
 		 378 aa  216  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  43.41 
 
 		 380 aa  216  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  38.67 
 
 		 380 aa  214  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2952  glycerate kinase  45.41 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  39.73 
 
 		 381 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  40.38 
 
 		 387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  43.75 
 
 		 382 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  43.75 
 
 		 382 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  38.13 
 
 		 381 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  36.88 
 
 		 394 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  43.06 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  43.75 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  43.75 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  40.28 
 
 		 381 aa  210  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  42.78 
 
 		 380 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  37.5 
 
 		 394 aa  210  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  35.31 
 
 		 384 aa  210  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  35.64 
 
 		 386 aa  210  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  42.78 
 
 		 380 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  37.47 
 
 		 378 aa  209  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  41.64 
 
 		 378 aa  209  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  40.53 
 
 		 384 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  34.41 
 
 		 380 aa  209  8e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  37.87 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  43.01 
 
 		 380 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2591  glycerate kinase  44.31 
 
 		 375 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  42.06 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  42.2 
 
 		 380 aa  206  6e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  38.13 
 
 		 377 aa  206  8e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0579  glycerate kinase  43.42 
 
 		 353 aa  205  9e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.513033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  39.3 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  41.39 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2233  glycerate kinase  40.36 
 
 		 384 aa  204  3e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  39.3 
 
 		 373 aa  203  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  38.4 
 
 		 381 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  36.27 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  38.97 
 
 		 383 aa  202  6e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  42.33 
 
 		 381 aa  202  7e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  34.3 
 
 		 381 aa  202  9e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3519  Glycerate kinase  45.75 
 
 		 397 aa  202  9e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0793  glycerate kinase 2  35.81 
 
 		 380 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.109169  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  37.57 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  42.33 
 
 		 381 aa  200  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  42.05 
 
 		 381 aa  201  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  42.33 
 
 		 381 aa  200  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  42.33 
 
 		 381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  42.33 
 
 		 381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1604  glycerate kinase  35.61 
 
 		 402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395644  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  42.05 
 
 		 381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>