216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2484 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA1468  glycerate kinase 1  99.74 
 
 		 387 aa  739    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2484  glycerate kinase 1  100 
 
 		 387 aa  742    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1961  glycerate kinase 1  99.47 
 
 		 380 aa  721    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3344  glycerate kinase 1  99.47 
 
 		 380 aa  721    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2327  glycerate kinase  98.46 
 
 		 389 aa  694    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.118083  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2368  glycerate kinase  100 
 
 		 387 aa  742    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1235  glycerate kinase 1  99.47 
 
 		 380 aa  721    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.338815  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2117  glycerate kinase 1  89.64 
 
 		 518 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6154  glycerate kinase  78.81 
 
 		 381 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1925  glycerate kinase  78.81 
 
 		 381 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1948  glycerate kinase  78.81 
 
 		 381 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0679177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5226  glycerate kinase  77 
 
 		 381 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1347  glycerate kinase  78.04 
 
 		 381 aa  527  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.067363  normal  0.0868647 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1913  glycerate kinase  77.52 
 
 		 381 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.4386  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1843  glycerate kinase  77 
 
 		 381 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250112  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2298  glycerate kinase  73.75 
 
 		 381 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1904  Glycerate kinase  72.97 
 
 		 381 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0448313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1009  glycerate kinase  71.06 
 
 		 381 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516875  normal  0.67759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  45.67 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  45.79 
 
 		 379 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  43.8 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  45.26 
 
 		 379 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  47.87 
 
 		 381 aa  242  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  43.39 
 
 		 379 aa  242  9e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2538  glycerate kinase  45 
 
 		 379 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2292  glycerate kinase  45.96 
 
 		 389 aa  237  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  45.5 
 
 		 380 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  46.6 
 
 		 394 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  46.67 
 
 		 388 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  46.67 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  48.4 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  46.67 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  43.42 
 
 		 381 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  39.69 
 
 		 381 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  40.53 
 
 		 382 aa  220  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  41.49 
 
 		 383 aa  219  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  39.15 
 
 		 377 aa  219  6e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  43.67 
 
 		 389 aa  219  7e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  46.03 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  38.48 
 
 		 380 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  39.95 
 
 		 381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  43.19 
 
 		 381 aa  216  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  39.15 
 
 		 387 aa  212  7e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2233  glycerate kinase  42.52 
 
 		 384 aa  211  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26280  glycerate kinase  40.79 
 
 		 385 aa  210  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0355581 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  40.53 
 
 		 381 aa  210  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  39.47 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  37.43 
 
 		 378 aa  208  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  37.43 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2952  glycerate kinase  45.77 
 
 		 386 aa  206  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  37.14 
 
 		 378 aa  206  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  40.37 
 
 		 388 aa  206  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  36.6 
 
 		 380 aa  206  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  37.17 
 
 		 378 aa  205  8e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  40.73 
 
 		 378 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  35.71 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0348  glycerate kinase  35.62 
 
 		 378 aa  204  3e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  32.72 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  33.25 
 
 		 386 aa  203  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  40.48 
 
 		 380 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  37.99 
 
 		 384 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  40.48 
 
 		 380 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  40.21 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  33.86 
 
 		 380 aa  199  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  40 
 
 		 380 aa  199  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  37.96 
 
 		 377 aa  199  6e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  40.21 
 
 		 380 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  39.95 
 
 		 380 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0793  glycerate kinase 2  35 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.109169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3602  glycerate kinase  32.9 
 
 		 381 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  34.48 
 
 		 385 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3692  glycerate kinase  40.42 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  34.48 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  34.99 
 
 		 384 aa  194  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3291  Glycerate kinase  38.95 
 
 		 380 aa  193  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000409322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  34.75 
 
 		 381 aa  193  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  34.75 
 
 		 381 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  35.25 
 
 		 392 aa  192  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1380  Glycerate kinase  41.76 
 
 		 379 aa  192  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  37.6 
 
 		 381 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1595  glycerate kinase  38.18 
 
 		 376 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2591  glycerate kinase  41.56 
 
 		 375 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  34.22 
 
 		 385 aa  190  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  35.9 
 
 		 373 aa  190  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0579  glycerate kinase  43.18 
 
 		 353 aa  189  5.999999999999999e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.513033  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  33.95 
 
 		 381 aa  189  5.999999999999999e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  38.5 
 
 		 381 aa  189  8e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  36.34 
 
 		 383 aa  189  8e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  35.9 
 
 		 373 aa  189  9e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1135  glycerate kinase  32.45 
 
 		 374 aa  189  9e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  36.8 
 
 		 381 aa  189  9e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  34.97 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  37.6 
 
 		 381 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  37.6 
 
 		 381 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  33.85 
 
 		 394 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  34.75 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  37.6 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  34.65 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0146  glycerate kinase  36.44 
 
 		 380 aa  187  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000400769  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  37.6 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>