216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1925 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5226  glycerate kinase  95.28 
 
 		 381 aa  662    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6154  glycerate kinase  100 
 
 		 381 aa  741    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1913  glycerate kinase  94.23 
 
 		 381 aa  650    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.4386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1925  glycerate kinase  100 
 
 		 381 aa  741    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1948  glycerate kinase  98.43 
 
 		 381 aa  729    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0679177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1843  glycerate kinase  93.7 
 
 		 381 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250112  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1347  glycerate kinase  92.65 
 
 		 381 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.067363  normal  0.0868647 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2327  glycerate kinase  78.15 
 
 		 389 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.118083  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2298  glycerate kinase  78.63 
 
 		 381 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1468  glycerate kinase 1  78.81 
 
 		 387 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2484  glycerate kinase 1  78.81 
 
 		 387 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2368  glycerate kinase  78.81 
 
 		 387 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1904  Glycerate kinase  78.22 
 
 		 381 aa  532  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0448313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1961  glycerate kinase 1  79.1 
 
 		 380 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3344  glycerate kinase 1  79.1 
 
 		 380 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1235  glycerate kinase 1  79.1 
 
 		 380 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.338815  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1009  glycerate kinase  75.99 
 
 		 381 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516875  normal  0.67759 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2117  glycerate kinase 1  79 
 
 		 518 aa  508  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  46.28 
 
 		 379 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  44.59 
 
 		 379 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  46.4 
 
 		 379 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2292  glycerate kinase  49.86 
 
 		 389 aa  242  6e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  48.27 
 
 		 381 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  44.47 
 
 		 379 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  45.33 
 
 		 379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  47.65 
 
 		 388 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  47.65 
 
 		 388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  47.65 
 
 		 388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  44.85 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  47.86 
 
 		 381 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2538  glycerate kinase  45.07 
 
 		 379 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  46.81 
 
 		 394 aa  229  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  43.62 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  47.07 
 
 		 378 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  44.33 
 
 		 380 aa  227  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26280  glycerate kinase  42.15 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0355581 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  43.65 
 
 		 381 aa  219  7.999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  39.47 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  39.18 
 
 		 380 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  38.93 
 
 		 381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0348  glycerate kinase  36.53 
 
 		 378 aa  213  7e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2233  glycerate kinase  40.21 
 
 		 384 aa  212  7.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  38.83 
 
 		 378 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  41.27 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2952  glycerate kinase  44.74 
 
 		 386 aa  210  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  35.04 
 
 		 384 aa  209  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  34.85 
 
 		 380 aa  209  7e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  36.97 
 
 		 392 aa  208  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2591  glycerate kinase  44.24 
 
 		 375 aa  205  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  40.38 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3291  Glycerate kinase  41.05 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000409322  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  40.56 
 
 		 387 aa  203  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  45.89 
 
 		 389 aa  203  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  38.71 
 
 		 384 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  40.56 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  38.93 
 
 		 395 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0793  glycerate kinase 2  35.81 
 
 		 380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.109169  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  41.21 
 
 		 380 aa  199  9e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  43.69 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  37.6 
 
 		 377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  36.77 
 
 		 384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  38.07 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  36.27 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  41.13 
 
 		 388 aa  197  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  36.27 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  38.07 
 
 		 373 aa  196  7e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  35.09 
 
 		 379 aa  196  7e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1478  glycerate kinase  37.47 
 
 		 378 aa  194  2e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3045  glycerate kinase  35.75 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0181471 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  39.39 
 
 		 378 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  44.03 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  36.53 
 
 		 381 aa  193  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  42.72 
 
 		 381 aa  193  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  43.04 
 
 		 381 aa  193  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  44.03 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  39.39 
 
 		 378 aa  193  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0579  glycerate kinase  42.69 
 
 		 353 aa  193  5e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.513033  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  35.84 
 
 		 394 aa  193  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  39.48 
 
 		 381 aa  192  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  41.92 
 
 		 380 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  41.92 
 
 		 380 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  36.05 
 
 		 384 aa  192  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  41.92 
 
 		 380 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  39.48 
 
 		 381 aa  192  7e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  41.92 
 
 		 381 aa  192  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  41.92 
 
 		 380 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  39.16 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  39.11 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  39.16 
 
 		 408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  39.16 
 
 		 408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  43.71 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  43.71 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  39.16 
 
 		 381 aa  190  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  39.16 
 
 		 381 aa  190  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  39.16 
 
 		 381 aa  190  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  41.37 
 
 		 380 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1982  glycerate kinase  42.86 
 
 		 369 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  42.72 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4863  glycerate kinase GcxK  37.2 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.432659  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  42.72 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>