216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1843 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5226  glycerate kinase  95.28 
 
 		 381 aa  659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6154  glycerate kinase  93.7 
 
 		 381 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1913  glycerate kinase  98.16 
 
 		 381 aa  725    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.4386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1925  glycerate kinase  93.7 
 
 		 381 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1347  glycerate kinase  92.39 
 
 		 381 aa  639    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.067363  normal  0.0868647 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1843  glycerate kinase  100 
 
 		 381 aa  738    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250112  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1948  glycerate kinase  92.91 
 
 		 381 aa  646    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0679177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2327  glycerate kinase  76.35 
 
 		 389 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.118083  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2298  glycerate kinase  76.9 
 
 		 381 aa  527  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1468  glycerate kinase 1  77 
 
 		 387 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2484  glycerate kinase 1  77 
 
 		 387 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2368  glycerate kinase  77 
 
 		 387 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1904  Glycerate kinase  76.9 
 
 		 381 aa  521  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0448313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1961  glycerate kinase 1  77.25 
 
 		 380 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3344  glycerate kinase 1  77.25 
 
 		 380 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1235  glycerate kinase 1  77.25 
 
 		 380 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.338815  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1009  glycerate kinase  74.67 
 
 		 381 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516875  normal  0.67759 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2117  glycerate kinase 1  77.69 
 
 		 518 aa  501  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  46.4 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2292  glycerate kinase  50.42 
 
 		 389 aa  250  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  45.14 
 
 		 379 aa  250  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  45.33 
 
 		 379 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  44.62 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  47.88 
 
 		 381 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  45.07 
 
 		 379 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  44.85 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2538  glycerate kinase  44.8 
 
 		 379 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  47.61 
 
 		 378 aa  227  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  48.42 
 
 		 381 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  46.81 
 
 		 388 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  46.81 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  46.81 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  44.5 
 
 		 380 aa  222  7e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  44.78 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  35.92 
 
 		 380 aa  216  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26280  glycerate kinase  40.79 
 
 		 385 aa  216  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0355581 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  39.84 
 
 		 381 aa  216  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  43.36 
 
 		 381 aa  216  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  40.96 
 
 		 381 aa  216  5.9999999999999996e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2233  glycerate kinase  41.13 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  39.2 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  39.45 
 
 		 380 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  41.6 
 
 		 382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  35.31 
 
 		 384 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0348  glycerate kinase  36.53 
 
 		 378 aa  210  3e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2952  glycerate kinase  44.21 
 
 		 386 aa  207  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  38.83 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  36.84 
 
 		 392 aa  206  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  42.82 
 
 		 389 aa  206  6e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  38.3 
 
 		 381 aa  205  8e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  38.03 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  40.38 
 
 		 387 aa  203  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  37.8 
 
 		 384 aa  202  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  39.47 
 
 		 395 aa  202  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3291  Glycerate kinase  37.89 
 
 		 380 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000409322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  42.15 
 
 		 383 aa  200  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  41.5 
 
 		 380 aa  199  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  38.3 
 
 		 381 aa  199  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  43.37 
 
 		 388 aa  199  6e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  41.95 
 
 		 380 aa  199  7e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  40.11 
 
 		 381 aa  199  9e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  35.75 
 
 		 379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  38.17 
 
 		 384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  37.33 
 
 		 377 aa  197  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  42.19 
 
 		 381 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0579  glycerate kinase  43.87 
 
 		 353 aa  196  5.000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.513033  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  34.48 
 
 		 386 aa  196  7e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  41.72 
 
 		 378 aa  196  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  41.72 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0793  glycerate kinase 2  36.36 
 
 		 380 aa  195  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.109169  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3045  glycerate kinase  35.75 
 
 		 377 aa  195  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0181471 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  36.58 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1575  glycerate kinase  35.68 
 
 		 403 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  41.41 
 
 		 378 aa  194  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  35.84 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  32.98 
 
 		 381 aa  193  4e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  39.74 
 
 		 378 aa  192  7e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  35.32 
 
 		 394 aa  192  9e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  36.49 
 
 		 385 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  36.49 
 
 		 381 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  36.84 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  37.23 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  36.64 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  38.53 
 
 		 383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2773  Glycerate kinase  35.26 
 
 		 402 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  hitchhiker  0.000390297 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  37.23 
 
 		 373 aa  190  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2591  glycerate kinase  41.34 
 
 		 375 aa  190  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  36.36 
 
 		 381 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  35.48 
 
 		 381 aa  189  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1604  glycerate kinase  35.01 
 
 		 402 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395644  normal  0.145781 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  36.57 
 
 		 408 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  36.36 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  36.36 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1478  glycerate kinase  35.58 
 
 		 378 aa  188  1e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  36.57 
 
 		 408 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  36.36 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  41.21 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  36.77 
 
 		 381 aa  188  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  40.43 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1570  glycerate kinase  35.77 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.769204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>