215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1009 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1009  glycerate kinase  100 
 
 		 381 aa  749    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516875  normal  0.67759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2298  glycerate kinase  84.25 
 
 		 381 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1904  Glycerate kinase  84.51 
 
 		 381 aa  588  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0448313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1347  glycerate kinase  76.78 
 
 		 381 aa  529  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.067363  normal  0.0868647 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5226  glycerate kinase  76.25 
 
 		 381 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6154  glycerate kinase  75.99 
 
 		 381 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1925  glycerate kinase  75.99 
 
 		 381 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1948  glycerate kinase  75.46 
 
 		 381 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0679177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1913  glycerate kinase  75.46 
 
 		 381 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.4386  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1843  glycerate kinase  74.67 
 
 		 381 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250112  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2327  glycerate kinase  70.44 
 
 		 389 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.118083  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2484  glycerate kinase 1  71.06 
 
 		 387 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2368  glycerate kinase  71.06 
 
 		 387 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1468  glycerate kinase 1  70.8 
 
 		 387 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1961  glycerate kinase 1  70.9 
 
 		 380 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3344  glycerate kinase 1  70.9 
 
 		 380 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1235  glycerate kinase 1  70.9 
 
 		 380 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.338815  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2117  glycerate kinase 1  70.54 
 
 		 518 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  46.13 
 
 		 379 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  46.28 
 
 		 380 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  45.6 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  47.47 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  45.6 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  47.47 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  47.47 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2292  glycerate kinase  48.58 
 
 		 389 aa  242  7.999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  45.98 
 
 		 394 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  45.3 
 
 		 381 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2538  glycerate kinase  45.33 
 
 		 379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  44.15 
 
 		 379 aa  236  7e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  43.51 
 
 		 379 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2672  glycerate kinase  45.33 
 
 		 381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  42.02 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  46.17 
 
 		 378 aa  229  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  45.19 
 
 		 381 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  38.68 
 
 		 377 aa  223  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  43.84 
 
 		 383 aa  220  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26280  glycerate kinase  41.19 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0355581 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3291  Glycerate kinase  40 
 
 		 380 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000409322  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  40.17 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50760  hypothetical protein  45.45 
 
 		 381 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0151848 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  38.38 
 
 		 378 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  39.73 
 
 		 380 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  38.93 
 
 		 381 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  38.48 
 
 		 392 aa  212  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  41.95 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  41.34 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  42.98 
 
 		 389 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  35.85 
 
 		 384 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  37.76 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  38.67 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  42.86 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  39.73 
 
 		 381 aa  206  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  34.85 
 
 		 380 aa  206  6e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0348  glycerate kinase  36.83 
 
 		 378 aa  206  6e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2952  glycerate kinase  43.24 
 
 		 386 aa  205  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  42.03 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  39.94 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  39.2 
 
 		 381 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  37.87 
 
 		 380 aa  202  8e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  40.11 
 
 		 381 aa  202  8e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  37.83 
 
 		 384 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  42.86 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  37.83 
 
 		 377 aa  200  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  42.55 
 
 		 378 aa  199  9e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  36.27 
 
 		 379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1575  glycerate kinase  35.52 
 
 		 403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  42.25 
 
 		 378 aa  197  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0793  glycerate kinase 2  37.13 
 
 		 380 aa  195  9e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.109169  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2591  glycerate kinase  42.77 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2773  Glycerate kinase  35.35 
 
 		 402 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  hitchhiker  0.000390297 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  35.84 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  41.5 
 
 		 380 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  34.76 
 
 		 386 aa  193  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  40 
 
 		 381 aa  193  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  37.63 
 
 		 384 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  40 
 
 		 381 aa  193  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1604  glycerate kinase  35.35 
 
 		 402 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395644  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  41.23 
 
 		 380 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  41.06 
 
 		 379 aa  192  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  36.75 
 
 		 384 aa  192  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  41.23 
 
 		 380 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  38.9 
 
 		 383 aa  192  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  39.68 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  39.68 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  39.68 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  41.34 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  39.68 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  40.95 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  39.68 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  39.68 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  39.7 
 
 		 380 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  40.13 
 
 		 381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  43.71 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  43.71 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3519  Glycerate kinase  42.82 
 
 		 397 aa  190  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  41.34 
 
 		 381 aa  190  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1380  Glycerate kinase  42.98 
 
 		 379 aa  189  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.824242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  43.71 
 
 		 382 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  43.71 
 
 		 382 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>