More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6167 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6167  aminotransferase class-III  100 
 
 
447 aa  909    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0237518 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6417  aminotransferase class-III  58.18 
 
 
443 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2401  aminotransferase class-III  57.35 
 
 
434 aa  485  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1467  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  58.64 
 
 
446 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.679584 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10913  Glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase, putative (Eurofung)  41.42 
 
 
449 aa  335  7.999999999999999e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01050  hypothetical protein  44.01 
 
 
405 aa  324  2e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2811  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  38.8 
 
 
426 aa  258  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1037  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  38.19 
 
 
426 aa  257  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2156  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  37.44 
 
 
432 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1244  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  38.37 
 
 
437 aa  254  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0781  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.23 
 
 
429 aa  252  8.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1340  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  38.42 
 
 
432 aa  251  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0223  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.23 
 
 
426 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.01485  normal  0.360359 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.99 
 
 
426 aa  249  5e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00257803  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1373  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.47 
 
 
427 aa  249  5e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3505  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.99 
 
 
426 aa  249  5e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0155655  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.99 
 
 
426 aa  249  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00152  hypothetical protein  36.99 
 
 
426 aa  249  5e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00215275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0158  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.99 
 
 
426 aa  249  7e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2411  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.77 
 
 
433 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.921175  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2361  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.77 
 
 
433 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3448  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  36.99 
 
 
426 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.44 
 
 
426 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.280272  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3103  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.62 
 
 
426 aa  249  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1175  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.85 
 
 
426 aa  249  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0166  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.99 
 
 
426 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0146  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.75 
 
 
426 aa  248  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0164  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.75 
 
 
426 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0995  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.39 
 
 
426 aa  247  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0221  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.99 
 
 
426 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00426685  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.99 
 
 
426 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3459  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.39 
 
 
426 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0694  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.99 
 
 
426 aa  247  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3330  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.39 
 
 
426 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.75 
 
 
426 aa  246  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00212628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4491  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  38.85 
 
 
429 aa  246  8e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.395249  normal  0.0453126 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3749  aminotransferase class-III  36.47 
 
 
445 aa  245  9.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1975  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  38.7 
 
 
439 aa  245  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102395  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  35.81 
 
 
626 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0659  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.3 
 
 
428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.59993 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3180  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.32 
 
 
422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.89 
 
 
428 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1701  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.98 
 
 
433 aa  241  2e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.173155  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2366  aminotransferase class-III  35.46 
 
 
438 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552116  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3348  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.19 
 
 
430 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2557  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.14 
 
 
425 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2741  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.84 
 
 
432 aa  241  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.534121  normal  0.227024 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2819  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.22 
 
 
433 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000400379  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1464  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.93 
 
 
424 aa  239  8e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1816  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.06 
 
 
432 aa  239  9e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04841  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.2 
 
 
432 aa  239  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00934887  normal  0.931792 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05401  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.25 
 
 
428 aa  239  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.198771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0624  aminotransferase class-III  37.15 
 
 
448 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2675  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  36.32 
 
 
432 aa  237  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4345  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.77 
 
 
432 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1204  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.95 
 
 
430 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.632015  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.95 
 
 
430 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.95 
 
 
430 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1789  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.8 
 
 
426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507749  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1119  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.25 
 
 
430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4920  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.56 
 
 
432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0943019 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1237  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.72 
 
 
430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0256114  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0291  aminotransferase class-III  33.71 
 
 
460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000819224  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0694  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  36.7 
 
 
431 aa  234  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0284  aminotransferase class-III  35.02 
 
 
452 aa  234  3e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00199891 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0865  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  36.52 
 
 
425 aa  234  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.281516  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0417  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  37.23 
 
 
426 aa  233  4.0000000000000004e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.237039  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1300  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.2 
 
 
430 aa  233  6e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0266  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.32 
 
 
427 aa  233  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1229  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.55 
 
 
432 aa  233  7.000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00808664  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2421  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  34.13 
 
 
422 aa  232  9e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000486284 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1432  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.53 
 
 
428 aa  231  1e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3288  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.03 
 
 
429 aa  232  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2975  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.03 
 
 
430 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3303  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.98 
 
 
430 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4480  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.86 
 
 
430 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.786256  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002591  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.28 
 
 
431 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00474755  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03417  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.7 
 
 
445 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2893  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.03 
 
 
430 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000688047 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2901  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.98 
 
 
430 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0920757  hitchhiker  0.00771881 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3071  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.8 
 
 
430 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.049853  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1012  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.35 
 
 
428 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000957306  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2530  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.35 
 
 
427 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00381454  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0484  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.34 
 
 
434 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.765409  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0154  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.96 
 
 
432 aa  231  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1088  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.46 
 
 
428 aa  230  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.80886  normal  0.019309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1396  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  34.17 
 
 
440 aa  230  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.209971 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1126  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.65 
 
 
429 aa  230  4e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4344  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.38 
 
 
430 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1171  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.46 
 
 
428 aa  229  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.154612  hitchhiker  0.0000102166 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4499  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.86 
 
 
430 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2577  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.37 
 
 
432 aa  229  7e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2011  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.5 
 
 
426 aa  229  8e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.956002  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2971  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  35.01 
 
 
433 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0875  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.38 
 
 
430 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2747  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  36.73 
 
 
452 aa  228  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2664  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.87 
 
 
428 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.940231  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05391  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.25 
 
 
433 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1253  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  35.71 
 
 
431 aa  228  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05101  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.25 
 
 
433 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>