More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF01050 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006691  CNF01050  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  832    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6417  aminotransferase class-III  42.82 
 
 
443 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1467  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  45.6 
 
 
446 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6167  aminotransferase class-III  44.01 
 
 
447 aa  359  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0237518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2401  aminotransferase class-III  43.57 
 
 
434 aa  349  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10913  Glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase, putative (Eurofung)  40.6 
 
 
449 aa  315  9.999999999999999e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2366  aminotransferase class-III  38.32 
 
 
438 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.552116  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2421  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  36 
 
 
422 aa  233  6e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000486284 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0291  aminotransferase class-III  31.21 
 
 
460 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000819224  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0624  aminotransferase class-III  34.26 
 
 
448 aa  226  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4245  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  38.42 
 
 
427 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000211848  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1464  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.84 
 
 
424 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3180  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.5 
 
 
422 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1253  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  35.48 
 
 
431 aa  218  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3103  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.02 
 
 
426 aa  216  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0694  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  40.62 
 
 
431 aa  216  7e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2811  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.9 
 
 
426 aa  215  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3139  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.89 
 
 
428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000990553  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3749  aminotransferase class-III  32.79 
 
 
445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1037  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.9 
 
 
426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0284  aminotransferase class-III  36.24 
 
 
452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00199891 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1328  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  34.52 
 
 
427 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0353724  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1975  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  33.65 
 
 
439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3927  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  38.62 
 
 
427 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000281902  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.71 
 
 
426 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.280272  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3304  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  34.88 
 
 
429 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0146  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.9 
 
 
426 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4345  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.15 
 
 
432 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2577  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.12 
 
 
432 aa  212  9e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04841  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.04 
 
 
432 aa  212  9e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00934887  normal  0.931792 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3356  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.27 
 
 
427 aa  212  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000584172  hitchhiker  0.00810852 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3448  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  31.9 
 
 
426 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3459  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.1 
 
 
426 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1175  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.3 
 
 
426 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0223  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.1 
 
 
426 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.01485  normal  0.360359 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3330  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.1 
 
 
426 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0166  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.9 
 
 
426 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4011  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  38.33 
 
 
427 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.49886e-31 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0995  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.1 
 
 
426 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.9 
 
 
426 aa  211  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00257803  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0193  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.03 
 
 
431 aa  210  3e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00152  hypothetical protein  31.9 
 
 
426 aa  211  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00215275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0158  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.9 
 
 
426 aa  210  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.9 
 
 
426 aa  211  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3505  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.9 
 
 
426 aa  211  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0155655  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2800  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.52 
 
 
431 aa  210  4e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.279066  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0164  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.9 
 
 
426 aa  210  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0569  aminotransferase class-III  30.73 
 
 
435 aa  209  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.110238 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2971  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  33.95 
 
 
433 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2411  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  38.19 
 
 
433 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.921175  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05101  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.8 
 
 
433 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2361  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  38.19 
 
 
433 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0391  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  38.44 
 
 
425 aa  209  8e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.551922  normal  0.195658 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0337  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.89 
 
 
427 aa  209  9e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00652219  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.86 
 
 
426 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0221  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.86 
 
 
426 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00426685  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0781  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.18 
 
 
429 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20256 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1816  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.01 
 
 
432 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05401  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.16 
 
 
428 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.198771 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.71 
 
 
426 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00212628  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1244  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  33.96 
 
 
437 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1373  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.82 
 
 
427 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1419  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.46 
 
 
444 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1325  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.46 
 
 
444 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0216  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.36 
 
 
417 aa  208  2e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000686637  normal  0.0344059 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2421  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.69 
 
 
428 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.23384  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0484  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.05 
 
 
434 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.765409  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0694  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.9 
 
 
426 aa  207  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1131  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.37 
 
 
427 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1208  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.17 
 
 
432 aa  207  4e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1537  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  34.67 
 
 
456 aa  206  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.033412  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1237  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  38.96 
 
 
430 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0256114  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0974  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.49 
 
 
429 aa  206  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2666  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.46 
 
 
428 aa  206  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0598472  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1119  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.45 
 
 
430 aa  206  7e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2747  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.62 
 
 
452 aa  206  7e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0202  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.42 
 
 
431 aa  206  8e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.518998  normal  0.0385329 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3683  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.17 
 
 
427 aa  206  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3288  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  38.92 
 
 
429 aa  205  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1204  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  38.65 
 
 
430 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.632015  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  38.65 
 
 
430 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  38.65 
 
 
430 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12390  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.37 
 
 
427 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0054  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  34.9 
 
 
426 aa  204  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1227  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.31 
 
 
422 aa  204  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000806301  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3071  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.45 
 
 
430 aa  204  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.049853  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05391  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.76 
 
 
433 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2156  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.54 
 
 
432 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1468  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.63 
 
 
427 aa  204  3e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.311379  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0417  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  35.14 
 
 
426 aa  203  3e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.237039  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1759  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.5 
 
 
428 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1725  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  37.5 
 
 
428 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395512  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0495  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.71 
 
 
431 aa  204  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2975  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.45 
 
 
430 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.64 
 
 
626 aa  203  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2819  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  39.06 
 
 
433 aa  203  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000400379  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1199  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  35.65 
 
 
437 aa  203  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1229  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.36 
 
 
432 aa  203  5e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00808664  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2741  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  36.59 
 
 
432 aa  203  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.534121  normal  0.227024 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1432  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  35.61 
 
 
428 aa  202  6e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>