60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4805 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4805  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  748    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337418  normal  0.112306 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4736  hypothetical protein  61.39 
 
 
392 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.378543  normal  0.971977 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0235  hypothetical protein  28.33 
 
 
376 aa  98.6  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.635295 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0973  membrane protein-like protein  28.72 
 
 
189 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2224  membrane protein-like protein  29.19 
 
 
188 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566223  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2328  membrane protein-like protein  29.38 
 
 
188 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529679  normal  0.28675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2344  membrane protein-like protein  29.32 
 
 
188 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2305  membrane protein-like protein  28.87 
 
 
188 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1693  membrane protein-like  28.87 
 
 
188 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5449  hypothetical protein  31.9 
 
 
189 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.962565 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  29.75 
 
 
724 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5647  membrane protein-like  28.35 
 
 
189 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.68 
 
 
697 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  28.19 
 
 
704 aa  52.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  29.75 
 
 
724 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  28.57 
 
 
659 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1292  fusaric acid resistance protein region  27.98 
 
 
681 aa  50.4  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.944306 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.68 
 
 
653 aa  50.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1484  hypothetical protein  29.87 
 
 
377 aa  49.3  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.356024  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1421  hypothetical membrane spanning protein  29.22 
 
 
377 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.230954  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.16 
 
 
670 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2192  Fusaric acid resistance protein conserved region  29.27 
 
 
671 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  27.15 
 
 
702 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  24.31 
 
 
698 aa  48.9  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  25.17 
 
 
700 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  26 
 
 
672 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  24.66 
 
 
718 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  34.25 
 
 
395 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  28.97 
 
 
736 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  28.68 
 
 
359 aa  46.6  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.2 
 
 
700 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  32 
 
 
734 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  32 
 
 
734 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  32 
 
 
734 aa  46.2  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  32.63 
 
 
733 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1157  hypothetical protein  30.77 
 
 
238 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  31.33 
 
 
733 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  31.33 
 
 
733 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  28.25 
 
 
729 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  22.75 
 
 
713 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.28 
 
 
739 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  24.09 
 
 
670 aa  44.3  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  28.74 
 
 
728 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  30.67 
 
 
734 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4212  hypothetical protein  28.82 
 
 
389 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  24.38 
 
 
697 aa  44.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1538  fusaric acid resistance domain protein  26.45 
 
 
679 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0513426  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0146  hypothetical protein  28.82 
 
 
389 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1902  fusaric acid resistance domain-containing protein  26.45 
 
 
679 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.48277  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3785  YccS/YhfK family integral membrane protein  26.02 
 
 
695 aa  44.3  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235879  hitchhiker  0.00807604 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0143  hypothetical protein  28.82 
 
 
388 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0147  hypothetical protein  28.82 
 
 
380 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.311964 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  37.29 
 
 
360 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0144  hypothetical protein  28.82 
 
 
371 aa  43.5  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  29.34 
 
 
354 aa  43.5  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  28.69 
 
 
676 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  27.71 
 
 
744 aa  43.1  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  31.25 
 
 
361 aa  43.1  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2032  hypothetical protein  30.59 
 
 
357 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1057  hypothetical protein  30.59 
 
 
357 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>