More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5367 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5367  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 
380 aa  753    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491855 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4429  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  83.42 
 
 
393 aa  624  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.104303  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4946  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  83.68 
 
 
381 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3214  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  83.68 
 
 
381 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1862  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  40.62 
 
 
370 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.324326  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6746  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.16 
 
 
368 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3336  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.13 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5519  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.74 
 
 
381 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2215  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.71 
 
 
378 aa  123  5e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.133795  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4435  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.16 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0118641  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3855  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.67 
 
 
370 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552694  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3136  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.96 
 
 
367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.207627 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1946  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.7 
 
 
378 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4533  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.49 
 
 
384 aa  116  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790465  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.88 
 
 
372 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0286824  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0038  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.65 
 
 
375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0032  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.39 
 
 
375 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2476  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.86 
 
 
378 aa  113  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3926  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.68 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3046  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  32.19 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.958371  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4061  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.9 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3858  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.8 
 
 
373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0581351  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1050  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.24 
 
 
381 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4981  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.39 
 
 
389 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.713473  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0897  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  28.26 
 
 
387 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.129101  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2394  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.43 
 
 
390 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.7542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0028  putative mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  34.47 
 
 
362 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370595  normal  0.102793 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1717  putative racemase  34.91 
 
 
359 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.640537  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3395  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  34.91 
 
 
369 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1125  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.86 
 
 
380 aa  103  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3370  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.26 
 
 
389 aa  102  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.90513  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3915  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.17 
 
 
398 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4083  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.17 
 
 
398 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.386649  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4022  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.17 
 
 
398 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4042  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.26 
 
 
379 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0918  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.9 
 
 
398 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908418  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3561  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.45 
 
 
396 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3977  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.17 
 
 
398 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.618282 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3211  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.01 
 
 
390 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.514043  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4643  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.61 
 
 
421 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3056  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.39 
 
 
390 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4358  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.62 
 
 
386 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370383  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5071  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.01 
 
 
390 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435068  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2476  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.98 
 
 
398 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4678  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30 
 
 
387 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194789  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3386  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.63 
 
 
398 aa  100  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2836  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  28.8 
 
 
390 aa  99.8  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.182529  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5451  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.95 
 
 
403 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.911825  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4982  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.6 
 
 
390 aa  98.6  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.601828  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4374  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.01 
 
 
390 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0244  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.43 
 
 
383 aa  98.2  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0781522  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5348  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.49 
 
 
396 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.628473 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5182  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.58 
 
 
403 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.028896  normal  0.168371 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2214  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.66 
 
 
378 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5055  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  29.01 
 
 
390 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.902489  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5805  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.01 
 
 
390 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598482  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0218  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.71 
 
 
381 aa  96.3  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0106637  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4975  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.41 
 
 
370 aa  95.9  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0890752 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0313  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.16 
 
 
371 aa  96.3  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3550  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  34.41 
 
 
376 aa  95.9  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0951632  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2405  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.1 
 
 
374 aa  96.3  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.44174  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1308  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30 
 
 
384 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0291  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.48 
 
 
403 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4653  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.46 
 
 
400 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0414891  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3887  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.17 
 
 
393 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3433  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.8 
 
 
381 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.428257  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4441  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.09 
 
 
391 aa  94.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0607658  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5866  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.77 
 
 
389 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0167811  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5408  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.96 
 
 
396 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00119776 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0122  galactonate dehydratase  29.02 
 
 
384 aa  94.4  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.041758  normal  0.798356 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3874  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.84 
 
 
401 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0228827  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2866  galactonate dehydratase  29.02 
 
 
382 aa  94.4  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4290  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.42 
 
 
385 aa  94.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0251584  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4388  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.28 
 
 
423 aa  94  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43815  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4153  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.64 
 
 
393 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5506  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.89 
 
 
366 aa  93.6  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204068  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6234  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.45 
 
 
392 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.297392  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2580  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.02 
 
 
369 aa  93.6  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3074  hypothetical protein  29.91 
 
 
391 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6403  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  29.15 
 
 
392 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6636  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.15 
 
 
392 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159226  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0232  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.6 
 
 
372 aa  92  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0239  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.6 
 
 
372 aa  92  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1497  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  36.16 
 
 
351 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.948555 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2447  putative mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.17 
 
 
391 aa  92  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.549803  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6193  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.95 
 
 
425 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2242  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.64 
 
 
412 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.464149  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5455  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.38 
 
 
369 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3195  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  30.64 
 
 
390 aa  91.7  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0466  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.98 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36070  hypothetical protein  29.49 
 
 
391 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000846029 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1139  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.67 
 
 
380 aa  91.7  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.422964 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0845  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.3 
 
 
392 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0154  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.78 
 
 
398 aa  90.9  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.434953  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5741  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.42 
 
 
386 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3894  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.86 
 
 
384 aa  90.5  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.519515  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7246  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.03 
 
 
380 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000177277  normal  0.41126 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2648  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  29.05 
 
 
383 aa  90.1  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000278082  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1685  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.97 
 
 
400 aa  90.1  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322016  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1303  gluconate dehydratase / galactonate dehydratase  27.76 
 
 
393 aa  90.1  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>