More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_28380 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_28380  carbohydrate ABC transporter membrane protein  100 
 
 
302 aa  591  1e-168  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.527648  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12340  sugar-transport integral membrane protein ABC transporter uspB  57.09 
 
 
274 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.14 
 
 
303 aa  299  3e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.359511  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.51 
 
 
273 aa  188  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.256296  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  34.69 
 
 
277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  34.32 
 
 
277 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
301 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  35.58 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.55 
 
 
280 aa  166  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 
722 aa  166  4e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0626826  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.03 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
271 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
272 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  34.91 
 
 
272 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0320  monosaccharide-transporting ATPase  39.79 
 
 
701 aa  162  6e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.48 
 
 
279 aa  162  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
284 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
311 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.155632  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0338  monosaccharide-transporting ATPase  40 
 
 
701 aa  160  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
303 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
294 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.466926 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
274 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.610741  hitchhiker  0.000350702 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
273 aa  159  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
279 aa  159  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000188602  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0383  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.67 
 
 
268 aa  159  8e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.32 
 
 
310 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
277 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.390959 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  34.48 
 
 
276 aa  156  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
311 aa  156  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
298 aa  156  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
302 aa  155  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.95 
 
 
743 aa  156  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.445152  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.73 
 
 
296 aa  155  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.11 
 
 
302 aa  155  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
270 aa  155  8e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
288 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
270 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
275 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
311 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.316897  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2532  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.79 
 
 
275 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  31.6 
 
 
281 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.83 
 
 
273 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.83 
 
 
273 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0449998  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
280 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0326071  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.46 
 
 
295 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.21 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  33.96 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.982521  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0605  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 
273 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
292 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.660216  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1618  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
198 aa  152  5e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7171  sugar transport system (permease)  34.14 
 
 
283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0389176 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4734  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 
273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 
273 aa  152  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.1 
 
 
274 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0631  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  30.22 
 
 
273 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0537  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease  30.6 
 
 
273 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0479  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  30.6 
 
 
273 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0481  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  30.6 
 
 
273 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0568  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease protein  30.6 
 
 
273 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2979  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
269 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.923594  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3574  Monosaccharide-transporting ATPase  33.06 
 
 
290 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0624  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 
273 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0699  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  30.22 
 
 
273 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
304 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
299 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
285 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  31.75 
 
 
278 aa  150  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.79 
 
 
313 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000624363 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
299 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0163331  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  33.06 
 
 
271 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 
271 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  31.94 
 
 
275 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  34.7 
 
 
278 aa  149  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
299 aa  148  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.42 
 
 
286 aa  146  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.143013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.441003 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12076  sugar ABC transporter membrane protein  30.18 
 
 
280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  33.2 
 
 
277 aa  145  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
285 aa  145  8.000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000816013  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2510  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  36 
 
 
278 aa  145  9e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.686515 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
298 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.15321  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 
289 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
293 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.18 
 
 
275 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2711  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  35.34 
 
 
281 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027951  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
284 aa  144  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.16 
 
 
390 aa  144  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
284 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0401383  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.41 
 
 
279 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0553602  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0728  putative permease protein of sugar ABC transporter  36.64 
 
 
263 aa  143  3e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1285  twin-arginine translocation pathway signal  32.36 
 
 
283 aa  144  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.7 
 
 
298 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337575  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.67 
 
 
281 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>