More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_23410 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_23410  Pirin-related protein  100 
 
 
348 aa  692    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0699691  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02280  Pirin-related protein  48.51 
 
 
335 aa  288  9e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2745  Pirin domain-containing protein  49.4 
 
 
319 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.211686  normal  0.964257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4144  Pirin domain protein  48.07 
 
 
329 aa  272  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.173069  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0100  Pirin domain protein  46.25 
 
 
335 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0663  pirin domain-containing protein  51.42 
 
 
351 aa  264  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3726  Pirin domain protein  44.91 
 
 
336 aa  263  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5681  pirin domain-containing protein  49.32 
 
 
317 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5391  pirin domain-containing protein  49.32 
 
 
317 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5302  Pirin-like protein  49.32 
 
 
317 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.178895  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0788  pirin domain-containing protein  45.1 
 
 
321 aa  258  8e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35540  Pirin-related protein  47.2 
 
 
381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0508  Pirin domain protein  44.44 
 
 
329 aa  252  6e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0062  pirin domain-containing protein  44.67 
 
 
321 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3190  Pirin domain protein  42.48 
 
 
351 aa  241  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3633  Pirin domain protein  47.02 
 
 
330 aa  236  5.0000000000000005e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2016  Pirin domain protein  41.98 
 
 
343 aa  209  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.656131  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2844  pirin domain-containing protein  37.87 
 
 
363 aa  192  9e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.923717  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0490  Pirin domain protein  40.24 
 
 
322 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0687764  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2245  hypothetical protein  40.18 
 
 
332 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169099  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1645  Pirin domain protein  37.98 
 
 
324 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3147  Pirin domain protein  38.54 
 
 
301 aa  177  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3476  Pirin domain protein  40.24 
 
 
319 aa  176  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.944311 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2558  Pirin domain protein  38.3 
 
 
336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000413123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4173  hypothetical protein  39.7 
 
 
332 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1778  Pirin-like protein  39.93 
 
 
313 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48730  hypothetical protein  40.45 
 
 
315 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159869 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0919  pirin domain-containing protein  39.49 
 
 
338 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200809  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2835  pirin domain-containing protein  37.17 
 
 
313 aa  162  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3541  pirin-like protein  36.36 
 
 
297 aa  158  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0050  Pirin-like protein  38.66 
 
 
301 aa  157  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2304  pirin domain-containing protein  32.86 
 
 
310 aa  149  7e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000453876  normal  0.0236921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0053  pirin domain-containing protein  35.02 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0053  pirin domain-containing protein  35.79 
 
 
307 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030122 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0050  pirin domain-containing protein  34.67 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0017274  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0055  pirin domain-containing protein  35.42 
 
 
307 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241022 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0061  pirin domain-containing protein  35.06 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4301  pirin domain-containing protein  33.33 
 
 
307 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.411445  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0057  Pirin domain protein  34.66 
 
 
307 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0058  pirin domain-containing protein  33.95 
 
 
307 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.00000580792 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2913  Pirin-like  35.92 
 
 
296 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1889  Pirin-like  35.02 
 
 
313 aa  137  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0649  Pirin-like protein  34.15 
 
 
294 aa  136  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0640  pirin-related protein  34.15 
 
 
291 aa  136  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.524638  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0608  Pirin domain protein  34.53 
 
 
307 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.228088 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2928  pirin domain-containing protein  39.93 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04763  pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  36.11 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0326  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  36.21 
 
 
291 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0273  Pirin-like protein  35.29 
 
 
291 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.355193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3696  Pirin domain protein  31.68 
 
 
300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.01108  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2484  pirin domain-containing protein  36.36 
 
 
293 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0887266 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2613  pirin domain-containing protein  35.86 
 
 
293 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2359  Pirin domain protein  33.02 
 
 
306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.355023 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2089  Pirin domain protein  34.51 
 
 
304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1954  Pirin-like  36.72 
 
 
293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0828005  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0566  Pirin domain protein  32.64 
 
 
307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.660641  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2565  pirin domain-containing protein  36.72 
 
 
293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0703  Pirin-like protein  36.13 
 
 
305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1805  Pirin domain protein  35.03 
 
 
296 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5163  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1965  pirin domain-containing protein  34.4 
 
 
309 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0286  pirin-related protein  35.21 
 
 
306 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4855  pirin domain-containing protein  35.97 
 
 
312 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2485  pirin domain-containing protein  33.55 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.110651 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0720  hypothetical protein  35.71 
 
 
340 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00526543  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2589  pirin domain-containing protein  35.41 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437288  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0588  putative pirin-like protein  35.29 
 
 
299 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.927348  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0493  pirin domain-containing protein  36.23 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0561  Pirin domain protein  35.87 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3490  pirin domain-containing protein  33.08 
 
 
293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.970505  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5897  Pirin-like protein  36 
 
 
293 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867942  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0421  pirin domain-containing protein  39.13 
 
 
298 aa  126  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0219  pirin  34.8 
 
 
306 aa  126  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0185  pirin domain-containing protein  35.25 
 
 
312 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0128  Pirin domain protein  35.25 
 
 
312 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.266704 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2983  Pirin domain protein  33.92 
 
 
287 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.373808  normal  0.0595027 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1817  pirin-like protein  33.57 
 
 
312 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123159  normal  0.257408 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0364  pirin domain-containing protein  35.44 
 
 
318 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0019  putative Pirin family protein  33.94 
 
 
305 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0346  Pirin-like  35.77 
 
 
305 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0734  Pirin-like  35.14 
 
 
306 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4923  Pirin domain protein  34.11 
 
 
310 aa  123  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.695284  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3218  Pirin domain protein  34.94 
 
 
291 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0744  hypothetical protein  35.19 
 
 
291 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738482  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3573  Pirin domain protein  36.01 
 
 
307 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3510  pirin domain-containing protein  35.48 
 
 
314 aa  122  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2897  Pirin-like  35.13 
 
 
294 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0149  Pirin-like  35.27 
 
 
305 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0009  Pirin-like  34.43 
 
 
306 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00543202  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3027  pirin domain-containing protein  36.07 
 
 
316 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0252  Pirin domain protein  32.97 
 
 
289 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.175941 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4570  pirin domain-containing protein  35.64 
 
 
296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203406  normal  0.316672 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1596  Pirin domain protein  35.29 
 
 
301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3748  pirin domain-containing protein  34.04 
 
 
287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3489  Pirin-like  36.14 
 
 
307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2513  Pirin-like  33.68 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3500  pirin domain-containing protein  34.04 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.324071  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3120  Pirin domain protein  35.64 
 
 
307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0362  hypothetical protein  36.82 
 
 
293 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0654105  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0662  hypothetical protein  36.82 
 
 
293 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.276579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2498  hypothetical protein  36.82 
 
 
293 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>