More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3476 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3476  Pirin domain protein  100 
 
 
319 aa  632  1e-180  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.944311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1645  Pirin domain protein  55.17 
 
 
324 aa  329  4e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2558  Pirin domain protein  53.39 
 
 
336 aa  322  4e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000413123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2844  pirin domain-containing protein  50.55 
 
 
363 aa  315  8e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.923717  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2245  hypothetical protein  53.46 
 
 
332 aa  289  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169099  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0788  pirin domain-containing protein  48.3 
 
 
321 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0508  Pirin domain protein  48.35 
 
 
329 aa  270  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2016  Pirin domain protein  47.66 
 
 
343 aa  268  8.999999999999999e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.656131  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0062  pirin domain-containing protein  47.22 
 
 
321 aa  264  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0100  Pirin domain protein  46.41 
 
 
335 aa  260  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3633  Pirin domain protein  45.73 
 
 
330 aa  258  9e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35540  Pirin-related protein  45.4 
 
 
381 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3726  Pirin domain protein  44.28 
 
 
336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3190  Pirin domain protein  44.73 
 
 
351 aa  251  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2745  Pirin domain-containing protein  45.26 
 
 
319 aa  249  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.211686  normal  0.964257 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5391  pirin domain-containing protein  48.17 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5302  Pirin-like protein  48.17 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.178895  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5681  pirin domain-containing protein  48.17 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4144  Pirin domain protein  44.85 
 
 
329 aa  243  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.173069  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1778  Pirin-like protein  46.89 
 
 
313 aa  239  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0490  Pirin domain protein  45.68 
 
 
322 aa  230  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0687764  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0050  Pirin-like protein  43.94 
 
 
301 aa  230  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0663  pirin domain-containing protein  45.02 
 
 
351 aa  228  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48730  hypothetical protein  43.79 
 
 
315 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159869 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4173  hypothetical protein  43.79 
 
 
332 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0919  pirin domain-containing protein  48.05 
 
 
338 aa  222  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200809  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3147  Pirin domain protein  43.94 
 
 
301 aa  219  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2835  pirin domain-containing protein  42.12 
 
 
313 aa  219  7e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02280  Pirin-related protein  41.94 
 
 
335 aa  218  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0053  pirin domain-containing protein  40 
 
 
307 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0050  pirin domain-containing protein  39.1 
 
 
307 aa  206  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0017274  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0057  Pirin domain protein  39.63 
 
 
307 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4301  pirin domain-containing protein  39.63 
 
 
307 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.411445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3541  pirin-like protein  38.13 
 
 
297 aa  203  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0058  pirin domain-containing protein  39.26 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.00000580792 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23410  Pirin-related protein  40.24 
 
 
348 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0699691  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0055  pirin domain-containing protein  40.44 
 
 
307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0053  pirin domain-containing protein  40.44 
 
 
307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0061  pirin domain-containing protein  39.71 
 
 
308 aa  196  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1965  pirin domain-containing protein  43.17 
 
 
309 aa  188  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0649  Pirin-like protein  41.46 
 
 
294 aa  188  9e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0566  Pirin domain protein  38.11 
 
 
307 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.660641  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4855  pirin domain-containing protein  41.7 
 
 
312 aa  185  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0608  Pirin domain protein  38.11 
 
 
307 aa  185  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.228088 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0128  Pirin domain protein  41.13 
 
 
312 aa  182  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.266704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0185  pirin domain-containing protein  40.78 
 
 
312 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0364  pirin domain-containing protein  41.2 
 
 
318 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0561  Pirin domain protein  39.78 
 
 
305 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0009  Pirin-like  40.51 
 
 
306 aa  178  9e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00543202  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0219  pirin  40.88 
 
 
306 aa  178  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3573  Pirin domain protein  42.46 
 
 
307 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2897  Pirin-like  39.53 
 
 
294 aa  176  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1805  Pirin domain protein  39.37 
 
 
296 aa  175  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5163  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0377  putative pirin-like protein  41.7 
 
 
289 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0435  pirin-related protein  37.41 
 
 
290 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3641  Pirin domain protein  40.85 
 
 
307 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0703  Pirin-like protein  39.05 
 
 
305 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2928  pirin domain-containing protein  40.88 
 
 
304 aa  169  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2143  pirin domain-containing protein  40.15 
 
 
305 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5556  Pirin domain protein  36.11 
 
 
304 aa  169  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.856561 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0346  Pirin-like  38.91 
 
 
305 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0149  Pirin-like  38.55 
 
 
305 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0019  putative Pirin family protein  37.96 
 
 
305 aa  168  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4570  pirin domain-containing protein  38.7 
 
 
296 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203406  normal  0.316672 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0233  Pirin domain protein  38.73 
 
 
289 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0252  Pirin domain protein  39.22 
 
 
289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.175941 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0493  pirin domain-containing protein  36.46 
 
 
307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0734  Pirin-like  36.5 
 
 
306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1666  pirin-related protein  34.84 
 
 
290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0486523  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2913  Pirin-like  39.29 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2089  Pirin domain protein  35.87 
 
 
304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3489  Pirin-like  41.55 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3120  Pirin domain protein  40.79 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0546  pirin domain-containing protein  36.36 
 
 
306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266378  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0273  Pirin-like protein  38.55 
 
 
291 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.355193 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3510  pirin domain-containing protein  37.37 
 
 
314 aa  162  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0326  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  40.15 
 
 
291 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2304  pirin domain-containing protein  33.01 
 
 
310 aa  160  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000453876  normal  0.0236921 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0286  pirin-related protein  37.23 
 
 
306 aa  158  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0640  pirin-related protein  36.26 
 
 
291 aa  158  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.524638  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0818  pirin domain-containing protein  36.86 
 
 
296 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1918  pirin domain-containing protein  37.76 
 
 
297 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.883605 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1266  pirin domain-containing protein  37.06 
 
 
294 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1300  pirin domain-containing protein  37.06 
 
 
294 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.0576323 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2116  pirin domain-containing protein  35.86 
 
 
297 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0157857  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1367  pirin domain-containing protein  37.06 
 
 
293 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0431465 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3490  pirin domain-containing protein  34.14 
 
 
293 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.970505  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5228  pirin domain-containing protein  37.32 
 
 
298 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739076  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3781  Pirin-like  36.27 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.871122 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2372  pirin domain-containing protein  36.55 
 
 
311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178763  normal  0.995053 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0907  Pirin-like  37.41 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2983  Pirin domain protein  37.19 
 
 
287 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.373808  normal  0.0595027 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1389  pirin domain-containing protein  37.41 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614726  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4532  Pirin-like protein  37.14 
 
 
294 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04763  pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  36.33 
 
 
296 aa  153  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0720  hypothetical protein  38.32 
 
 
340 aa  153  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00526543  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1817  pirin-like protein  35.82 
 
 
312 aa  153  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123159  normal  0.257408 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2359  Pirin domain protein  36 
 
 
306 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.355023 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3218  Pirin domain protein  37.59 
 
 
291 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2513  Pirin-like  36.1 
 
 
311 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.277892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>