61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5559 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 402 bp  797    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  99.75 
 
 		 402 bp  789    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4856  integrase catalytic subunit  99.72 
 
 		 732 bp  1421    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3310  integrase catalytic subunit  99.72 
 
 		 732 bp  1421    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3311  transposase IS3/IS911 family protein  99.75 
 
 		 402 bp  789    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  98.76 
 
 		 402 bp  757    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1930  transposase  97.99 
 
 		 894 bp  1629    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1232  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6833  integrase catalytic subunit  99.88 
 
 		 837 bp  1651    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 402 bp  797    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5055  integrase catalytic region  100 
 
 		 837 bp  1659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5094  integrase catalytic region  100 
 
 		 837 bp  1659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 402 bp  797    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5559    100 
 
 		 6537 bp  12960    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261619 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 402 bp  797    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121852 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5564  integrase catalytic region  100 
 
 		 837 bp  1659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.923042  normal  0.135572 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0717  transposase  92.03 
 
 		 708 bp  559  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2605  Integrase catalytic region  83.01 
 
 		 822 bp  347  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.238238 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0716  transposase  96.24 
 
 		 186 bp  313  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  82.98 
 
 		 402 bp  238  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  82.93 
 
 		 2607 bp  236  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3308  transposase  99.18 
 
 		 138 bp  234  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1993  integrase catalytic subunit  82.28 
 
 		 837 bp  218  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.140355 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2556  integrase catalytic subunit  82.28 
 
 		 837 bp  218  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.369957 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  80.59 
 
 		 402 bp  167  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  80.59 
 
 		 402 bp  167  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1830  ISRSO10-transposase ORFB protein  86.86 
 
 		 849 bp  165  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.189696  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1435  ISRSO10-transposase ORFB protein  86.86 
 
 		 603 bp  165  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0927886  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2331  ISRSO10-transposase ORFB protein  86.86 
 
 		 888 bp  165  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0460  ISRSO10-transposase ORFB protein  86.86 
 
 		 603 bp  165  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112224  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0567  ISRSO10-transposase ORFB protein  86.29 
 
 		 849 bp  157  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6582  transposase  85.91 
 
 		 675 bp  129  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2744  transposase  85.23 
 
 		 888 bp  121  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.936564  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2584  transposase  85.23 
 
 		 888 bp  121  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161826  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1536  transposase  85.23 
 
 		 888 bp  121  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1453  transposase  85.23 
 
 		 888 bp  121  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0096  transposase  85.23 
 
 		 888 bp  121  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.679096  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0366  transposase  85.23 
 
 		 888 bp  121  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4251  integrase catalytic region  90.67 
 
 		 903 bp  93.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564242 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  84.62 
 
 		 2559 bp  79.8  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  94 
 
 		 2562 bp  75.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1792  integrase catalytic region  81.01 
 
 		 846 bp  75.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540172 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  86.49 
 
 		 2544 bp  67.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  86.49 
 
 		 2562 bp  67.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  88.14 
 
 		 2553 bp  61.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  90 
 
 		 3192 bp  60  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  80.14 
 
 		 3174 bp  60  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  90 
 
 		 3192 bp  60  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  84.42 
 
 		 2688 bp  58  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  84.42 
 
 		 2688 bp  58  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  79.5 
 
 		 3192 bp  58  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4974  transposase IS3/IS911  82.18 
 
 		 417 bp  58  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000160707  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  84.42 
 
 		 2688 bp  58  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  87.5 
 
 		 2772 bp  56  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5774  transposase  96.88 
 
 		 375 bp  56  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39486  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  94.29 
 
 		 369 bp  54  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  86.44 
 
 		 3180 bp  54  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5565  hypothetical protein  100 
 
 		 1002 bp  52  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3204  normal  0.0640212 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  88 
 
 		 2676 bp  52  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  93.94 
 
 		 3225 bp  50.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3635    83.56 
 
 		 198 bp  50.1  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000000645875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6414  integrase catalytic region  83.12 
 
 		 822 bp  50.1  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>