More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4977 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4296  condensation domain-containing protein  99.78 
 
 
453 aa  917    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88888  normal  0.427241 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4977  condensation domain-containing protein  100 
 
 
453 aa  919    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3183  condensation domain-containing protein  100 
 
 
453 aa  919    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.653152 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  37.79 
 
 
1498 aa  266  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  33.49 
 
 
1336 aa  246  6e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.25 
 
 
2385 aa  241  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.49 
 
 
2385 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.35 
 
 
2385 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  32.12 
 
 
2385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.12 
 
 
2385 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  32.18 
 
 
2385 aa  234  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.68 
 
 
2385 aa  234  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  37.3 
 
 
4106 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.12 
 
 
2385 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  31.34 
 
 
2386 aa  234  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.75 
 
 
2385 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  32.86 
 
 
1317 aa  230  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  36.9 
 
 
3710 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  31.12 
 
 
2386 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  33.56 
 
 
1449 aa  209  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  34.03 
 
 
1413 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1117  nonribosomal peptide synthetase DhbF  36.68 
 
 
1082 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1287  nonribosomal peptide synthetase DhbF  36.68 
 
 
1082 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0118  nonribosomal peptide synthetase DhbF  36.68 
 
 
1071 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0308  nonribosomal peptide synthetase DhbF  36.68 
 
 
1082 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  34.82 
 
 
3629 aa  207  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0269  nonribosomal peptide synthetase DhbF  36.45 
 
 
1082 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1791  non-ribosomal peptide synthase  36.21 
 
 
1082 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  31.46 
 
 
1334 aa  202  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1704  non-ribosomal peptide synthase  36.21 
 
 
1082 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2017  amino acid adenylation domain protein  33.04 
 
 
1419 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0369158  normal  0.503018 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3734  amino acid adenylation domain protein  31.32 
 
 
2691 aa  179  5.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21190  enterochelin sythetase component F (Serine-activating enzyme) (Seryl-AMP ligase)  32.62 
 
 
1330 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  35.49 
 
 
8211 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5064  amino acid adenylation domain protein  32.09 
 
 
4449 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  30.92 
 
 
5750 aa  158  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3427  enterobactin synthase subunit F  29.4 
 
 
1325 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168919  normal  0.066928 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2719  amino acid adenylation domain protein  32.12 
 
 
3410 aa  153  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20780  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  28.47 
 
 
3539 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.040794 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3056  enterobactin synthase subunit F  27.7 
 
 
1310 aa  149  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1322  amino acid adenylation domain protein  27.31 
 
 
2877 aa  145  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1746  amino acid adenylation domain protein  30.36 
 
 
3532 aa  145  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000653127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3715  amino acid adenylation domain protein  28.87 
 
 
4520 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2564  enterobactin synthase subunit F  29.1 
 
 
1304 aa  141  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.276813  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0465  amino acid adenylation domain protein  27.65 
 
 
1047 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.774823  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1119  enterobactin synthase subunit F  27.75 
 
 
1290 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2387  condensation domain-containing protein  31.37 
 
 
449 aa  139  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.157838  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1494  amino acid adenylation domain protein  27.83 
 
 
2846 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21160  Condensation domain protein  27.23 
 
 
432 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3733  amino acid adenylation domain protein  25.96 
 
 
2855 aa  133  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3397  putative non-ribosomal peptide synthetase  26.43 
 
 
734 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.804151 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1686  amino acid adenylation domain-containing protein  28.02 
 
 
1304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0746  enterobactin synthase subunit F  27 
 
 
1294 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0014  putative enterobactin synthetase, component F  27.52 
 
 
446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4519  amino acid adenylation domain-containing protein  29.61 
 
 
1478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.669 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0017  enterobactin synthetase, component F, putative  29.57 
 
 
469 aa  127  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0700  enterobactin synthase subunit F  25.93 
 
 
1294 aa  126  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.651012  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3987  amino acid adenylation domain protein  27.25 
 
 
3786 aa  126  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0684  enterobactin synthase subunit F  26.39 
 
 
1294 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.885796 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0671  enterobactin synthase subunit F  28.02 
 
 
1293 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3098  amino acid adenylation domain-containing protein  26.34 
 
 
3524 aa  126  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3040  amino acid adenylation domain protein  28.5 
 
 
1293 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3058  enterobactin synthase subunit F  28.26 
 
 
1293 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184112  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0641  enterobactin synthase subunit F  25.93 
 
 
1294 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0627  enterobactin synthase subunit F  25.86 
 
 
1294 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0636  enterobactin synthase subunit F  28.26 
 
 
1293 aa  123  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00553  enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP-dependent  28.26 
 
 
1293 aa  122  9e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0283628  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00542  hypothetical protein  28.26 
 
 
1293 aa  122  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0422505  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0606  enterobactin synthase subunit F  27.46 
 
 
1293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630178  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0606  enterobactin synthase subunit F  28.26 
 
 
1293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0642  amino acid adenylation domain protein  27.57 
 
 
1282 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.163069  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2272  enterobactin synthase subunit F  28.07 
 
 
1296 aa  116  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0155539  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  26.74 
 
 
9498 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09680  AMP-dependent synthetase and ligase family protein  25.06 
 
 
1292 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19190  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  24.84 
 
 
3648 aa  106  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.349458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0974  condensation domain-containing protein  26.54 
 
 
448 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2033  amino acid adenylation domain protein  22.86 
 
 
1740 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0167329 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  22.97 
 
 
1093 aa  94.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  23.75 
 
 
1786 aa  93.6  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  23.53 
 
 
2679 aa  90.9  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  23.1 
 
 
6676 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1970  amino acid adenylation domain-containing protein  25.22 
 
 
1137 aa  87.4  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0949143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3408  amino acid adenylation domain protein  22.47 
 
 
3207 aa  87  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2211  amino acid adenylation  23.57 
 
 
2136 aa  87  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  27.62 
 
 
3639 aa  87  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0488  enterobactin synthase subunit F  31.16 
 
 
1293 aa  86.3  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0304  vibriobactin synthetase, amide synthase subunit VibH  25.18 
 
 
438 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3185  amino acid adenylation domain protein  26.8 
 
 
1668 aa  84.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0410873  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  24.66 
 
 
3335 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  24.42 
 
 
2710 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21020  putative non-ribosomal peptide synthetase  28.94 
 
 
2352 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  21.84 
 
 
4531 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1971  amino acid adenylation domain-containing protein  30.56 
 
 
1109 aa  81.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.353817 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0618  putative peptide synthetase  22.99 
 
 
1483 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.099304  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1646  putative peptide synthetase  22.99 
 
 
1483 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2102  amino acid adenylation domain-containing protein  20.42 
 
 
1481 aa  80.9  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.73819  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1733  putative peptide synthetase  22.99 
 
 
1528 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1938  putative peptide synthetase  22.99 
 
 
1520 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1972  amino acid adenylation domain-containing protein  27.71 
 
 
3018 aa  80.1  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.812164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  23.11 
 
 
7122 aa  80.1  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>