More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0304 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0304  vibriobactin synthetase, amide synthase subunit VibH  100 
 
 
438 aa  895    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0014  putative enterobactin synthetase, component F  37.01 
 
 
446 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0017  enterobactin synthetase, component F, putative  37.01 
 
 
469 aa  236  6e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2387  condensation domain-containing protein  33.88 
 
 
449 aa  229  7e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.157838  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0974  condensation domain-containing protein  33.64 
 
 
448 aa  215  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2564  enterobactin synthase subunit F  30.24 
 
 
1304 aa  179  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.276813  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  29.31 
 
 
1413 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2272  enterobactin synthase subunit F  29.64 
 
 
1296 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0155539  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1494  amino acid adenylation domain protein  30.02 
 
 
2846 aa  136  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  29.04 
 
 
5750 aa  133  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  25.53 
 
 
2385 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  26.06 
 
 
2385 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  26.38 
 
 
2385 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  25.32 
 
 
1498 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1117  nonribosomal peptide synthetase DhbF  25.78 
 
 
1082 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1287  nonribosomal peptide synthetase DhbF  25.78 
 
 
1082 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0118  nonribosomal peptide synthetase DhbF  25.78 
 
 
1071 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0308  nonribosomal peptide synthetase DhbF  25.78 
 
 
1082 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  25.77 
 
 
2385 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1791  non-ribosomal peptide synthase  25.54 
 
 
1082 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1704  non-ribosomal peptide synthase  25.78 
 
 
1082 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  25.06 
 
 
2386 aa  123  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  22.57 
 
 
2386 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  23.11 
 
 
2385 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0269  nonribosomal peptide synthetase DhbF  25.3 
 
 
1082 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0465  amino acid adenylation domain protein  28.04 
 
 
1047 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.774823  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4519  amino acid adenylation domain-containing protein  28.21 
 
 
1478 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.669 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  22.75 
 
 
2385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3056  enterobactin synthase subunit F  26.13 
 
 
1310 aa  120  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  22.51 
 
 
2385 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  22.51 
 
 
2385 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  22.51 
 
 
2385 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3397  putative non-ribosomal peptide synthetase  26.26 
 
 
734 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.804151 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1746  amino acid adenylation domain protein  24.37 
 
 
3532 aa  119  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000653127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  24.94 
 
 
4106 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  26.7 
 
 
1449 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2017  amino acid adenylation domain protein  26.95 
 
 
1419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0369158  normal  0.503018 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  24.29 
 
 
1317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  23.86 
 
 
1336 aa  109  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  23.66 
 
 
3629 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0627  enterobactin synthase subunit F  26.68 
 
 
1294 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0641  enterobactin synthase subunit F  26.86 
 
 
1294 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1686  amino acid adenylation domain-containing protein  24.94 
 
 
1304 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0606  enterobactin synthase subunit F  25.87 
 
 
1293 aa  108  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0671  enterobactin synthase subunit F  26.1 
 
 
1293 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3040  amino acid adenylation domain protein  26.1 
 
 
1293 aa  107  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0700  enterobactin synthase subunit F  26.33 
 
 
1294 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.651012  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0636  enterobactin synthase subunit F  25.87 
 
 
1293 aa  106  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1322  amino acid adenylation domain protein  26.28 
 
 
2877 aa  106  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00553  enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP-dependent  25.87 
 
 
1293 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0283628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3058  enterobactin synthase subunit F  25.87 
 
 
1293 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184112  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19190  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  22.74 
 
 
3648 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.349458 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0606  enterobactin synthase subunit F  25.87 
 
 
1293 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630178  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00542  hypothetical protein  25.87 
 
 
1293 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0422505  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0746  enterobactin synthase subunit F  25.12 
 
 
1294 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3098  amino acid adenylation domain-containing protein  24.82 
 
 
3524 aa  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0488  enterobactin synthase subunit F  25.87 
 
 
1293 aa  103  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20780  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  22.64 
 
 
3539 aa  103  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.040794 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21190  enterochelin sythetase component F (Serine-activating enzyme) (Seryl-AMP ligase)  26.29 
 
 
1330 aa  101  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0684  enterobactin synthase subunit F  26.99 
 
 
1294 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.885796 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3427  enterobactin synthase subunit F  25.24 
 
 
1325 aa  98.6  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168919  normal  0.066928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  23.95 
 
 
1334 aa  97.4  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3733  amino acid adenylation domain protein  25.49 
 
 
2855 aa  97.4  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21160  Condensation domain protein  23.72 
 
 
432 aa  96.3  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5064  amino acid adenylation domain protein  23.34 
 
 
4449 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3734  amino acid adenylation domain protein  26.25 
 
 
2691 aa  94  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1119  enterobactin synthase subunit F  23.57 
 
 
1290 aa  92.8  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  22.83 
 
 
4531 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  25.46 
 
 
8211 aa  89.7  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2719  amino acid adenylation domain protein  24.46 
 
 
3410 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0965  amino acid adenylation domain protein  19.88 
 
 
1506 aa  88.6  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  24 
 
 
9498 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4977  condensation domain-containing protein  25.67 
 
 
453 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3183  condensation domain-containing protein  25.67 
 
 
453 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.653152 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4296  condensation domain-containing protein  25.67 
 
 
453 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88888  normal  0.427241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  24.34 
 
 
3710 aa  87.8  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1782  amino acid adenylation domain-containing protein  22.01 
 
 
1476 aa  86.7  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3715  amino acid adenylation domain protein  22.52 
 
 
4520 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2102  amino acid adenylation domain-containing protein  22.93 
 
 
1481 aa  84.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.73819  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3987  amino acid adenylation domain protein  24.36 
 
 
3786 aa  81.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2390  amino acid adenylation domain protein  18.63 
 
 
1490 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.215425  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2829  non-ribosomal peptide synthetase SyfA  22.65 
 
 
3168 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2211  amino acid adenylation  22.36 
 
 
2136 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  21.21 
 
 
2439 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0642  amino acid adenylation domain protein  23.19 
 
 
1282 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.163069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2576  amino acid adenylation  25.18 
 
 
3165 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  21.8 
 
 
6676 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  27.31 
 
 
5929 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0023  linear gramicidin synthetase subunit B  23.29 
 
 
2681 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  26.32 
 
 
2721 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  23.78 
 
 
6889 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09680  AMP-dependent synthetase and ligase family protein  24.29 
 
 
1292 aa  70.5  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  27.74 
 
 
5926 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  23.74 
 
 
5372 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  21.58 
 
 
1518 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  28.65 
 
 
2596 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  23.79 
 
 
2457 aa  66.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  24.94 
 
 
2154 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  23.08 
 
 
1518 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  23.98 
 
 
4136 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>