More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3397 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3397  putative non-ribosomal peptide synthetase  100 
 
 
734 aa  1520    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.804151 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  34.27 
 
 
1413 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2017  amino acid adenylation domain protein  34.58 
 
 
1419 aa  366  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0369158  normal  0.503018 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21190  enterochelin sythetase component F (Serine-activating enzyme) (Seryl-AMP ligase)  34.48 
 
 
1330 aa  346  8e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.91 
 
 
2385 aa  319  9e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  30.08 
 
 
2386 aa  316  8e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  30.25 
 
 
2385 aa  313  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.23 
 
 
2385 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.61 
 
 
2385 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.22 
 
 
2385 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.96 
 
 
2385 aa  310  6.999999999999999e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.96 
 
 
2385 aa  310  6.999999999999999e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  29.96 
 
 
2385 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.34 
 
 
2385 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1686  amino acid adenylation domain-containing protein  30.96 
 
 
1304 aa  300  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0465  amino acid adenylation domain protein  32.08 
 
 
1047 aa  292  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.774823  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  29.36 
 
 
2386 aa  291  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4519  amino acid adenylation domain-containing protein  30.97 
 
 
1478 aa  290  9e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.669 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  28.93 
 
 
1317 aa  279  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  28.33 
 
 
3629 aa  267  5.999999999999999e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2272  enterobactin synthase subunit F  30.8 
 
 
1296 aa  266  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0155539  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  27.9 
 
 
1336 aa  259  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  27.4 
 
 
1498 aa  246  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1322  amino acid adenylation domain protein  28.13 
 
 
2877 aa  239  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1119  enterobactin synthase subunit F  27.99 
 
 
1290 aa  238  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  27.35 
 
 
1449 aa  234  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0700  enterobactin synthase subunit F  27.32 
 
 
1294 aa  233  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.651012  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  26.02 
 
 
4106 aa  233  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0269  nonribosomal peptide synthetase DhbF  26.4 
 
 
1082 aa  232  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0641  enterobactin synthase subunit F  27.18 
 
 
1294 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1704  non-ribosomal peptide synthase  26.26 
 
 
1082 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0118  nonribosomal peptide synthetase DhbF  26.4 
 
 
1071 aa  231  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1791  non-ribosomal peptide synthase  26.26 
 
 
1082 aa  231  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1117  nonribosomal peptide synthetase DhbF  26.4 
 
 
1082 aa  231  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0308  nonribosomal peptide synthetase DhbF  26.4 
 
 
1082 aa  231  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1287  nonribosomal peptide synthetase DhbF  26.4 
 
 
1082 aa  231  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0746  enterobactin synthase subunit F  26.9 
 
 
1294 aa  230  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0627  enterobactin synthase subunit F  26.85 
 
 
1294 aa  228  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3733  amino acid adenylation domain protein  27.28 
 
 
2855 aa  226  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0684  enterobactin synthase subunit F  27.32 
 
 
1294 aa  225  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.885796 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3056  enterobactin synthase subunit F  25.28 
 
 
1310 aa  219  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2564  enterobactin synthase subunit F  27.3 
 
 
1304 aa  215  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.276813  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0606  enterobactin synthase subunit F  26.76 
 
 
1293 aa  214  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630178  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  26.96 
 
 
5750 aa  213  7.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1494  amino acid adenylation domain protein  26.39 
 
 
2846 aa  213  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3058  enterobactin synthase subunit F  26.34 
 
 
1293 aa  207  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184112  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0606  enterobactin synthase subunit F  26.48 
 
 
1293 aa  206  9e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0636  enterobactin synthase subunit F  26.2 
 
 
1293 aa  205  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0488  enterobactin synthase subunit F  26.34 
 
 
1293 aa  205  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3040  amino acid adenylation domain protein  26.2 
 
 
1293 aa  204  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00553  enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP-dependent  26.2 
 
 
1293 aa  204  6e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0283628  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00542  hypothetical protein  26.2 
 
 
1293 aa  204  6e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0422505  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2719  amino acid adenylation domain protein  26.44 
 
 
3410 aa  204  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5064  amino acid adenylation domain protein  25.57 
 
 
4449 aa  203  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0642  amino acid adenylation domain protein  26.76 
 
 
1282 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.163069  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3427  enterobactin synthase subunit F  25.38 
 
 
1325 aa  200  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168919  normal  0.066928 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0671  enterobactin synthase subunit F  26.34 
 
 
1293 aa  200  7.999999999999999e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20780  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  25.45 
 
 
3539 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.040794 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  25.32 
 
 
1334 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3734  amino acid adenylation domain protein  26.42 
 
 
2691 aa  198  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09680  AMP-dependent synthetase and ligase family protein  25.24 
 
 
1292 aa  196  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  24.17 
 
 
2164 aa  193  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  28.05 
 
 
3710 aa  192  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  25.47 
 
 
3086 aa  190  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  25.47 
 
 
3086 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3740  amino acid adenylation domain protein  25.14 
 
 
2395 aa  187  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209532 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  25.14 
 
 
3824 aa  187  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1782  amino acid adenylation domain-containing protein  22.16 
 
 
1476 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  24.9 
 
 
2664 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3686  amino acid adenylation domain protein  24.76 
 
 
2395 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3098  amino acid adenylation domain-containing protein  25.97 
 
 
3524 aa  178  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  24.36 
 
 
1556 aa  177  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  25.35 
 
 
7785 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2390  amino acid adenylation domain protein  21.95 
 
 
1490 aa  174  6.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.215425  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3715  amino acid adenylation domain protein  25.35 
 
 
4520 aa  174  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  24.83 
 
 
6889 aa  172  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21160  Condensation domain protein  28.5 
 
 
432 aa  172  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1746  amino acid adenylation domain protein  25.21 
 
 
3532 aa  171  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000653127 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  25.27 
 
 
13537 aa  172  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  23.92 
 
 
1556 aa  172  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19190  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  24.97 
 
 
3648 aa  171  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.349458 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3987  amino acid adenylation domain protein  23.44 
 
 
3786 aa  167  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  25.31 
 
 
5953 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  24.31 
 
 
3308 aa  165  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  23.76 
 
 
9498 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  24.73 
 
 
3498 aa  161  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  24.01 
 
 
4531 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  23.78 
 
 
5926 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  23.23 
 
 
3761 aa  159  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  23.32 
 
 
2439 aa  158  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  25 
 
 
6072 aa  158  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  25.76 
 
 
2187 aa  158  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  25 
 
 
6006 aa  158  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  25 
 
 
3328 aa  157  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  25 
 
 
3352 aa  157  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  25 
 
 
6081 aa  157  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  23.35 
 
 
2138 aa  156  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  23.97 
 
 
1454 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  24.69 
 
 
6676 aa  156  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  25.41 
 
 
8211 aa  156  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>