More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2387 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2387  condensation domain-containing protein  100 
 
 		 449 aa  895    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.157838  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0017  enterobactin synthetase, component F, putative  43.89 
 
 		 469 aa  346  5e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0014  putative enterobactin synthetase, component F  43.67 
 
 		 446 aa  343  5e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0974  condensation domain-containing protein  43.19 
 
 		 448 aa  306  5.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0304  vibriobactin synthetase, amide synthase subunit VibH  33.88 
 
 		 438 aa  229  9e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2564  enterobactin synthase subunit F  37.36 
 
 		 1304 aa  206  8e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.276813  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  31.69 
 
 		 1498 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2272  enterobactin synthase subunit F  35.8 
 
 		 1296 aa  180  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0155539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1805  amino acid adenylation domain-containing protein  30.81 
 
 		 1413 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.323791  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  32.04 
 
 		 1449 aa  162  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  25 
 
 		 2386 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1119  enterobactin synthase subunit F  30.41 
 
 		 1290 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  25.62 
 
 		 2386 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1494  amino acid adenylation domain protein  33.98 
 
 		 2846 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  32.24 
 
 		 5750 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21160  Condensation domain protein  27.83 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  25.86 
 
 		 2385 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0746  enterobactin synthase subunit F  30.99 
 
 		 1294 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  25.59 
 
 		 2385 aa  152  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  26.55 
 
 		 1336 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  25.37 
 
 		 2385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  24.76 
 
 		 2385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0700  enterobactin synthase subunit F  31.95 
 
 		 1294 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.651012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  25.37 
 
 		 2385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0641  enterobactin synthase subunit F  31.23 
 
 		 1294 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0627  enterobactin synthase subunit F  31.23 
 
 		 1294 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  25.37 
 
 		 2385 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  30.39 
 
 		 4106 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0684  enterobactin synthase subunit F  31.48 
 
 		 1294 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.885796 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0671  enterobactin synthase subunit F  30.25 
 
 		 1293 aa  146  9e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  25.12 
 
 		 2385 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  25.12 
 
 		 2385 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1322  amino acid adenylation domain protein  30.84 
 
 		 2877 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0606  enterobactin synthase subunit F  29.83 
 
 		 1293 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  25.12 
 
 		 2385 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1686  amino acid adenylation domain-containing protein  31.96 
 
 		 1304 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  30.51 
 
 		 3629 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3058  enterobactin synthase subunit F  29.83 
 
 		 1293 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184112  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00553  enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP-dependent  29.9 
 
 		 1293 aa  144  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0283628  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00542  hypothetical protein  29.9 
 
 		 1293 aa  144  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0422505  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0636  enterobactin synthase subunit F  29.9 
 
 		 1293 aa  143  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3040  amino acid adenylation domain protein  29.65 
 
 		 1293 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3427  enterobactin synthase subunit F  28.25 
 
 		 1325 aa  140  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168919  normal  0.066928 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4296  condensation domain-containing protein  31.37 
 
 		 453 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88888  normal  0.427241 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3056  enterobactin synthase subunit F  27.71 
 
 		 1310 aa  140  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4977  condensation domain-containing protein  31.37 
 
 		 453 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3183  condensation domain-containing protein  31.37 
 
 		 453 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.653152 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0606  enterobactin synthase subunit F  29.5 
 
 		 1293 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2017  amino acid adenylation domain protein  28.97 
 
 		 1419 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0369158  normal  0.503018 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0269  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.97 
 
 		 1082 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0488  enterobactin synthase subunit F  28.72 
 
 		 1293 aa  139  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  26.71 
 
 		 1317 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1117  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.19 
 
 		 1082 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0308  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.19 
 
 		 1082 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1287  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.19 
 
 		 1082 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3733  amino acid adenylation domain protein  29.59 
 
 		 2855 aa  137  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0118  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.19 
 
 		 1071 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2719  amino acid adenylation domain protein  31.03 
 
 		 3410 aa  136  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21190  enterochelin sythetase component F (Serine-activating enzyme) (Seryl-AMP ligase)  30.02 
 
 		 1330 aa  136  9e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1791  non-ribosomal peptide synthase  28.5 
 
 		 1082 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3715  amino acid adenylation domain protein  28.34 
 
 		 4520 aa  134  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3098  amino acid adenylation domain-containing protein  26.98 
 
 		 3524 aa  133  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4519  amino acid adenylation domain-containing protein  30.86 
 
 		 1478 aa  132  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.669 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1704  non-ribosomal peptide synthase  28.5 
 
 		 1082 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  26.08 
 
 		 1334 aa  130  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5064  amino acid adenylation domain protein  28.97 
 
 		 4449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19190  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  27.96 
 
 		 3648 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.349458 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1746  amino acid adenylation domain protein  30.23 
 
 		 3532 aa  125  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000653127 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20780  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  28.35 
 
 		 3539 aa  124  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.040794 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3397  putative non-ribosomal peptide synthetase  25.82 
 
 		 734 aa  120  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.804151 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0465  amino acid adenylation domain protein  26.09 
 
 		 1047 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.774823  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  27.08 
 
 		 3710 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  27.46 
 
 		 8211 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3734  amino acid adenylation domain protein  27.9 
 
 		 2691 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3987  amino acid adenylation domain protein  24.83 
 
 		 3786 aa  100  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  27.48 
 
 		 1369 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  27.45 
 
 		 2370 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  25.08 
 
 		 4531 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  26.3 
 
 		 13537 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09680  AMP-dependent synthetase and ligase family protein  22.82 
 
 		 1292 aa  87.8  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0642  amino acid adenylation domain protein  25.11 
 
 		 1282 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.163069  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  26.29 
 
 		 8646 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  24.73 
 
 		 6889 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  22.27 
 
 		 6676 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  27.03 
 
 		 4383 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1793  amino acid adenylation  26.06 
 
 		 1370 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0250793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3051  amino acid adenylation domain-containing protein  24.67 
 
 		 1457 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3063  amino acid adenylation domain-containing protein  24.83 
 
 		 5620 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.384616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  26.04 
 
 		 4502 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  26.37 
 
 		 5953 aa  80.1  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  30.96 
 
 		 7712 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  25.47 
 
 		 9498 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2829  non-ribosomal peptide synthetase SyfA  27.67 
 
 		 3168 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2211  amino acid adenylation  24.01 
 
 		 2136 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  26.7 
 
 		 2193 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  32.18 
 
 		 4317 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2576  amino acid adenylation  26.57 
 
 		 3165 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  25.79 
 
 		 5926 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  27.63 
 
 		 2457 aa  72  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  24.32 
 
 		 8914 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>