More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2266 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2266  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 		 336 aa  660    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.116618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0801  alcohol dehydrogenase  36.59 
 
 		 324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.763632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1132  alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 		 353 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2697  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.23 
 
 		 364 aa  135  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02437  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  30.23 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02401  hypothetical protein  30.23 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2830  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  30.23 
 
 		 364 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1123  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.94 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2698  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.94 
 
 		 364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0127  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.17 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1821  alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 		 344 aa  126  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00641517  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  30.35 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4226  alcohol dehydrogenase  29.55 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  30.35 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  30.06 
 
 		 341 aa  123  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  29.48 
 
 		 341 aa  123  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  29.19 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  29.19 
 
 		 341 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  30.06 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  29.19 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  29.19 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  29.19 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  29.19 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  29.48 
 
 		 341 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  29.48 
 
 		 341 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  29.48 
 
 		 341 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  29.19 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  30.68 
 
 		 361 aa  112  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  28.32 
 
 		 343 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2224  L-threonine 3-dehydrogenase  29.52 
 
 		 344 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1810  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.01 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  29.27 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3616  L-threonine 3-dehydrogenase  29.48 
 
 		 342 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00121447  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2072  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.01 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0808  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.01 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1099  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.01 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.488512  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  27.04 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4823  L-threonine 3-dehydrogenase  28.03 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204753 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  28.03 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  28.03 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2700  L-threonine 3-dehydrogenase  29.67 
 
 		 345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  28.03 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0364  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.73 
 
 		 378 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1376  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.09 
 
 		 363 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.482993 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2076  L-threonine 3-dehydrogenase  28.36 
 
 		 342 aa  109  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0654334  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  28.32 
 
 		 343 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0353  L-threonine 3-dehydrogenase  27.71 
 
 		 343 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  32.28 
 
 		 341 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 		 341 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0660  alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 		 341 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 		 341 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0565  alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 		 341 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 		 341 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 		 341 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 		 341 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0121  L-threonine 3-dehydrogenase  27.41 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0757  L-threonine 3-dehydrogenase  28.61 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0739  L-threonine 3-dehydrogenase  28.61 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0459  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.44 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.479531  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  28.03 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  28.03 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  28.03 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  28.03 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4989  L-threonine 3-dehydrogenase  28.03 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3953  L-threonine 3-dehydrogenase  28.03 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0503034  normal  0.824331 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  28.03 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0119  L-threonine 3-dehydrogenase  28.03 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  27.75 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  27.75 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  27.75 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  27.75 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  27.75 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  26.48 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  28.03 
 
 		 341 aa  106  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03240  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  27.33 
 
 		 358 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129511  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2958  L-threonine 3-dehydrogenase  28.61 
 
 		 345 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108215  normal  0.634974 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1995  L-threonine 3-dehydrogenase  27.79 
 
 		 348 aa  106  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.271324  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0201  L-threonine 3-dehydrogenase  27.79 
 
 		 342 aa  106  6e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1853  L-threonine 3-dehydrogenase  27.89 
 
 		 344 aa  106  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.981388  normal  0.0441816 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  28.02 
 
 		 341 aa  106  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0837  L-threonine 3-dehydrogenase  26.63 
 
 		 343 aa  105  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178921  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1795  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.16 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0530  L-threonine 3-dehydrogenase  27.19 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4120  L-threonine 3-dehydrogenase  27.75 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357417  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3757  L-threonine 3-dehydrogenase  31.85 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.119635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  32.93 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6089  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.74 
 
 		 337 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1353  L-threonine 3-dehydrogenase  29.82 
 
 		 348 aa  102  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000813951 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3944  L-threonine 3-dehydrogenase  28.19 
 
 		 342 aa  102  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1941  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.68 
 
 		 317 aa  102  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3793  L-threonine 3-dehydrogenase  26.01 
 
 		 341 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0050  L-threonine 3-dehydrogenase  28.65 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7277  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.09 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2661  L-threonine 3-dehydrogenase  27.19 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.97 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4160  L-threonine 3-dehydrogenase  27.79 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.48 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7003  L-threonine 3-dehydrogenase  27.49 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2923  L-threonine 3-dehydrogenase  27.43 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2931  L-threonine 3-dehydrogenase  30.7 
 
 		 343 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.217588  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>