More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2354 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2354  high-affinity L-arabinose transport system membrane protein, fragment  100 
 
 		 107 aa  209  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1057  L-arabinose transport system permease protein AraH  98.13 
 
 		 125 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.566506  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0047  L-arabinose transporter permease protein  85.71 
 
 		 339 aa  183  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.149615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3208  L-arabinose transporter permease protein  85.71 
 
 		 339 aa  183  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4919  L-arabinose transporter permease protein  84.82 
 
 		 339 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.259607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5474  L-arabinose transporter permease protein  84.82 
 
 		 335 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4590  L-arabinose transporter permease protein  84.82 
 
 		 337 aa  180  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280966 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5220  L-arabinose transporter permease protein  84.82 
 
 		 341 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5639  L-arabinose transporter permease protein  84.82 
 
 		 341 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356357  normal  0.0453459 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0846  putative arabinose ABC transporter, permease protein  94.85 
 
 		 125 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1142  L-arabinose transport system permease protein AraH  94.95 
 
 		 125 aa  177  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4219  L-arabinose transporter permease protein  83.33 
 
 		 338 aa  173  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3962  L-arabinose transporter permease protein  84.11 
 
 		 334 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2600  L-arabinose transporter permease protein  79.82 
 
 		 336 aa  166  9e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.860073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3010  L-arabinose transporter permease protein  79.82 
 
 		 336 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1626  L-arabinose transporter permease protein  86.27 
 
 		 339 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1021  L-arabinose transporter permease protein  66.36 
 
 		 333 aa  139  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  56.31 
 
 		 315 aa  111  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  52.94 
 
 		 335 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  49.07 
 
 		 338 aa  104  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  52.94 
 
 		 335 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  52.94 
 
 		 335 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2762  L-arabinose transporter permease protein  50 
 
 		 338 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.84256  normal  0.399817 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0548  L-arabinose transporter permease protein  49.07 
 
 		 338 aa  104  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0318738  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3409  L-arabinose transporter permease protein  49.07 
 
 		 338 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0925142  normal  0.0828764 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3602  L-arabinose transporter permease protein  52.43 
 
 		 317 aa  104  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3705  L-arabinose transporter permease protein  50.96 
 
 		 338 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256894  normal  0.416608 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0591  L-arabinose transporter permease protein  50.96 
 
 		 338 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  normal  0.0412649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0140  L-arabinose transporter permease protein  50.96 
 
 		 338 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.907828  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3475  L-arabinose transporter permease protein  53.77 
 
 		 316 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0623  L-arabinose transporter permease protein  50.96 
 
 		 338 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000899793  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01867  fused L-arabinose transporter subunits of ABC superfamily: membrane components  50.46 
 
 		 329 aa  103  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1744  Monosaccharide-transporting ATPase  50.46 
 
 		 328 aa  103  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.629454  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01856  hypothetical protein  50.46 
 
 		 329 aa  103  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2130  L-arabinose transporter permease protein  49.55 
 
 		 328 aa  103  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000455443  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1023  L-arabinose transporter permease protein  49.55 
 
 		 328 aa  103  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1736  L-arabinose transporter permease protein  50.46 
 
 		 328 aa  103  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.612736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1995  L-arabinose transporter permease protein  50.46 
 
 		 328 aa  103  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00340389  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1287  L-arabinose transporter permease protein  49.55 
 
 		 328 aa  103  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00785622  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  52.83 
 
 		 316 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2635  L-arabinose transporter permease protein  50.93 
 
 		 328 aa  103  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.348948  hitchhiker  0.00000000000485021 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0524  L-arabinose transporter permease protein  50 
 
 		 338 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299001  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0548  L-arabinose transporter permease protein  50 
 
 		 338 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0287231  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1181  L-arabinose transporter permease protein  49.07 
 
 		 334 aa  103  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  48.65 
 
 		 327 aa  102  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2484  L-arabinose transporter permease protein  49.07 
 
 		 334 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3482  L-arabinose transporter permease protein  49.07 
 
 		 334 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456756  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0404  L-arabinose transporter permease protein  49.07 
 
 		 334 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.15645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1264  L-arabinose transporter permease protein  49.07 
 
 		 334 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3446  L-arabinose transporter permease protein  49.07 
 
 		 334 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3484  L-arabinose transporter permease protein  49.07 
 
 		 334 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3301  L-arabinose transporter permease protein  49.07 
 
 		 334 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2474  L-arabinose transporter permease protein  49.55 
 
 		 326 aa  102  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.552924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1883  L-arabinose transporter permease protein  49.55 
 
 		 349 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1997  L-arabinose transporter permease protein  49.55 
 
 		 349 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.254059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2263  L-arabinose transporter permease protein  48.65 
 
 		 349 aa  100  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2331  L-arabinose transporter permease protein  49.54 
 
 		 328 aa  99  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266483  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2031  L-arabinose transporter permease protein  49.54 
 
 		 328 aa  99.4  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2147  L-arabinose transporter permease protein  49.54 
 
 		 328 aa  97.8  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1910  L-arabinose transporter permease protein  49.54 
 
 		 328 aa  97.4  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2373  L-arabinose transporter permease protein  49.04 
 
 		 329 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00546665  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2640  L-arabinose ABC transporter, permease protein  48.08 
 
 		 329 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0418311  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4139  L-arabinose transporter permease protein  47.12 
 
 		 322 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.494868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0584  D-xylose ABC transporter, permease  40.57 
 
 		 357 aa  87.4  6e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0063  inner-membrane translocator  38.68 
 
 		 394 aa  84  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0081  inner-membrane translocator  38.68 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806759  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4434  inner-membrane translocator  39.62 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4152  inner-membrane translocator  39.62 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0153  inner-membrane translocator  37.74 
 
 		 393 aa  82.8  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03420  D-xylose transporter subunit  37.74 
 
 		 393 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0142  Monosaccharide-transporting ATPase  37.74 
 
 		 393 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4064  D-xylose ABC transporter, permease protein  37.74 
 
 		 393 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3771  D-xylose ABC transporter, permease protein  37.74 
 
 		 393 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0101  monosaccharide-transporting ATPase  38.68 
 
 		 394 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03371  hypothetical protein  37.74 
 
 		 393 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  38.68 
 
 		 394 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4944  D-xylose ABC transporter, permease protein  37.74 
 
 		 393 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0184849 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  38.68 
 
 		 394 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  38.68 
 
 		 394 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3954  D-xylose ABC transporter, permease protein  37.74 
 
 		 393 aa  82  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3891  D-xylose ABC transporter, permease protein  37.74 
 
 		 393 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0146  monosaccharide-transporting ATPase  37.74 
 
 		 393 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2341  sugar ABC transporter, permease protein  37.04 
 
 		 399 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.718143  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  34.26 
 
 		 315 aa  77.8  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19480  Monosaccharide-transporting ATPase  33.94 
 
 		 383 aa  77.8  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  36.45 
 
 		 348 aa  77.4  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6036  monosaccharide-transporting ATPase  36.11 
 
 		 399 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.182695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6336  inner-membrane translocator  36.11 
 
 		 399 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4211  monosaccharide-transporting ATPase  36.11 
 
 		 405 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4188  Monosaccharide-transporting ATPase  37.96 
 
 		 400 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6502  inner-membrane translocator  36.11 
 
 		 399 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6736  inner-membrane translocator  36.11 
 
 		 399 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254772  normal  0.595345 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4076  Monosaccharide-transporting ATPase  37.96 
 
 		 400 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.784913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6325  monosaccharide-transporting ATPase  36.11 
 
 		 399 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38895 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  37.96 
 
 		 313 aa  75.5  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 316 aa  74.3  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1152  D-xylose ABC transporter, permease protein  37.96 
 
 		 389 aa  73.9  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1057  D-xylose ABC transporter, permease protein  37.96 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4915  Monosaccharide-transporting ATPase  37.38 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3072  monosaccharide-transporting ATPase  37.74 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372878  normal  0.819045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>