75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5702 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5702  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  100 
 
 		 372 aa  773    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1584  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  87.63 
 
 		 372 aa  686    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4554  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  86.25 
 
 		 373 aa  675    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1591  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  86.83 
 
 		 372 aa  684    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.442624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4159  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  65.59 
 
 		 359 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3103  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  59.46 
 
 		 368 aa  481  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1563  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  61.08 
 
 		 392 aa  479  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.246626  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2912  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  57.3 
 
 		 368 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1044  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  59.23 
 
 		 368 aa  464  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.131119 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3299  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  57.03 
 
 		 368 aa  463  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1011  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  57.3 
 
 		 368 aa  464  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0246  Methionine synthase vitamin-B12 independent  59.24 
 
 		 371 aa  454  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1987  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  57.57 
 
 		 367 aa  451  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.130415 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2698  methionine synthase, vitamin-B12 independent  48 
 
 		 373 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0426462  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3388  methionine synthase, vitamin-B12 independent  50.41 
 
 		 377 aa  364  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.101975  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1586  methionine synthase, vitamin-B12 independent  48.67 
 
 		 371 aa  363  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1745  Methionine synthase vitamin-B12 independent  49.73 
 
 		 373 aa  361  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.963683  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1559  Methionine synthase vitamin-B12 independent  48.79 
 
 		 369 aa  360  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1870  methionine synthase, vitamin-B12 independent  46.95 
 
 		 378 aa  352  8e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36700  methionine synthase II (cobalamin-independent)  47.73 
 
 		 373 aa  350  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.829252  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3379  Methionine synthase vitamin-B12 independent  48.55 
 
 		 376 aa  350  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.101236  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1081  methionine synthase, vitamin-B12 independent  45.77 
 
 		 379 aa  341  1e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.351458  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1661  hypothetical protein  46.74 
 
 		 366 aa  338  9.999999999999999e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1801  methionine synthase II (cobalamin-independent)  45.73 
 
 		 375 aa  332  5e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3283  Methionine synthase vitamin-B12 independent  42.64 
 
 		 394 aa  325  9e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1718  hypothetical protein  42.43 
 
 		 378 aa  322  8e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1803  hypothetical protein  43.32 
 
 		 375 aa  314  1.9999999999999998e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0268  Methionine synthase vitamin-B12 independent  42.32 
 
 		 375 aa  307  2.0000000000000002e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0752  hypothetical protein  41.94 
 
 		 369 aa  306  3e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.751192  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2926  Methionine synthase vitamin-B12 independent  41.64 
 
 		 367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1190  methionine synthase II (cobalamin-independent)  39.52 
 
 		 385 aa  271  1e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3115  Methionine synthase vitamin-B12 independent  39.57 
 
 		 366 aa  266  5e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05019  Methionine synthase, vitamin-B12 independent, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12060)  35.2 
 
 		 438 aa  223  6e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.807041 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0933  methionine synthase (B12-independent)  35.73 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.254746  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1254  MetE protein  35.34 
 
 		 385 aa  204  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0585  methionine synthase vitamin-B12 independent  26.09 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.246635  hitchhiker  0.00634375 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1170  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocystei ne methyltransferase  24.46 
 
 		 388 aa  93.6  6e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2516  methionine synthase, vitamin-B12 independent  24.32 
 
 		 340 aa  92.8  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2758  methionine synthase vitamin-B12 independent  24.02 
 
 		 340 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000302857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0030  methionine synthase, vitamin-B12 independent  23.66 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0945  methionine synthase vitamin-B12 independent  23.38 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.8649  hitchhiker  0.000170069 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0648  methionine synthase (B12-independent)  22.82 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1072  methionine synthase, vitamin-B12 independent  22.69 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.564481 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2108  methionine synthase  23.33 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.112744  normal  0.0912449 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1089  Methionine synthase vitamin-B12 independent  23.27 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0080  methionine synthase  23.31 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0497366  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0981  methionine synthase vitamin-B12 independent  23.23 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2396  Methionine synthase vitamin-B12 independent  21.88 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2667  methionine synthase  23.56 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1757  methionine synthase  22.68 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5820  Methionine synthase vitamin-B12 independent  22.67 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.392769 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2248  methionine synthase  20.35 
 
 		 331 aa  59.3  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.88722  normal  0.0178602 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2409  methionine synthase, vitamin-B12 independent  22.37 
 
 		 377 aa  53.1  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1385  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine S-methyltransferase  20.85 
 
 		 332 aa  52.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.25974  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04810  methionine synthase II (cobalamin-independent)  31.87 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0581869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2188  methionine synthase (B12-independent)  22.41 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3721  Methionine synthase vitamin-B12 independent  20.5 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0129115  normal  0.3687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1991  methionine synthase, vitamin-B12 independent  22.76 
 
 		 390 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4334  Methionine synthase vitamin-B12 independent  22.04 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0520376  normal  0.182105 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1726  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  21.57 
 
 		 348 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0182289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8776  MetE  21.35 
 
 		 367 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5267  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  21.49 
 
 		 340 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.562242 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4810  methionine synthase (B12-independent)  20.4 
 
 		 370 aa  47  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12410  methionine synthase II (cobalamin-independent)  21.74 
 
 		 403 aa  46.6  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00635164  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02310  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate- homocysteine S-methyltransferase, putative  26.06 
 
 		 763 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1756  Cobalamin-independent synthase MetE domain protein  21.82 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3839  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  20.82 
 
 		 343 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2113  Methionine synthase vitamin-B12 independent  22.04 
 
 		 353 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.044306  normal  0.413093 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0538  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine S-methyltransferase  24.18 
 
 		 767 aa  44.3  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.952319  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20790  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  21.87 
 
 		 343 aa  44.3  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2808  Methionine synthase II (cobalamin-independent)- like protein  23.59 
 
 		 395 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1122  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine S-methyltransferase  22.77 
 
 		 755 aa  43.9  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0904662  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3466  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  21.59 
 
 		 343 aa  43.1  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1489  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine S-methyltransferase  32.05 
 
 		 735 aa  42.7  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00335848  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0521  methionine synthase, vitamin-B12 independent  21.55 
 
 		 361 aa  42.7  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>