49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4159 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4159  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  100 
 
 		 359 aa  734    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1591  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  69.09 
 
 		 372 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.442624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4554  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  68.73 
 
 		 373 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5702  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  65.59 
 
 		 372 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1584  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  68.01 
 
 		 372 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2912  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  48.65 
 
 		 368 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3103  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  48.11 
 
 		 368 aa  364  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1563  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  50 
 
 		 392 aa  360  2e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.246626  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1044  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  49.59 
 
 		 368 aa  358  7e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.131119 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3299  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  47.57 
 
 		 368 aa  355  5.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1011  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  47.57 
 
 		 368 aa  355  6.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1987  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine methyltransferase  48.38 
 
 		 367 aa  351  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.130415 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0246  Methionine synthase vitamin-B12 independent  48.92 
 
 		 371 aa  350  2e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1586  methionine synthase, vitamin-B12 independent  45.43 
 
 		 371 aa  315  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1559  Methionine synthase vitamin-B12 independent  44.44 
 
 		 369 aa  305  8.000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3379  Methionine synthase vitamin-B12 independent  47.44 
 
 		 376 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.101236  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36700  methionine synthase II (cobalamin-independent)  44.92 
 
 		 373 aa  302  5.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.829252  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1745  Methionine synthase vitamin-B12 independent  45.23 
 
 		 373 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.963683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3388  methionine synthase, vitamin-B12 independent  44.41 
 
 		 377 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.101975  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2698  methionine synthase, vitamin-B12 independent  40.91 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0426462  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1870  methionine synthase, vitamin-B12 independent  42.13 
 
 		 378 aa  273  3e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1081  methionine synthase, vitamin-B12 independent  39.95 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.351458  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3283  Methionine synthase vitamin-B12 independent  39.69 
 
 		 394 aa  259  7e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1661  hypothetical protein  39.94 
 
 		 366 aa  258  8e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1718  hypothetical protein  38.46 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1801  methionine synthase II (cobalamin-independent)  39.29 
 
 		 375 aa  252  6e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1803  hypothetical protein  39.08 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0752  hypothetical protein  36.56 
 
 		 369 aa  231  1e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.751192  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0268  Methionine synthase vitamin-B12 independent  36.66 
 
 		 375 aa  229  7e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3115  Methionine synthase vitamin-B12 independent  35.6 
 
 		 366 aa  224  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2926  Methionine synthase vitamin-B12 independent  36.76 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1190  methionine synthase II (cobalamin-independent)  33.95 
 
 		 385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0933  methionine synthase (B12-independent)  35.22 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.254746  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05019  Methionine synthase, vitamin-B12 independent, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12060)  32.14 
 
 		 438 aa  187  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.807041 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1254  MetE protein  29.4 
 
 		 385 aa  142  7e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0585  methionine synthase vitamin-B12 independent  26.29 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.246635  hitchhiker  0.00634375 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1170  5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocystei ne methyltransferase  24.65 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0648  methionine synthase (B12-independent)  23.5 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0030  methionine synthase, vitamin-B12 independent  22.92 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0945  methionine synthase vitamin-B12 independent  22.64 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.8649  hitchhiker  0.000170069 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2758  methionine synthase vitamin-B12 independent  23.64 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000302857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2516  methionine synthase, vitamin-B12 independent  23.03 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57162 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1072  methionine synthase, vitamin-B12 independent  22.35 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.564481 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0080  methionine synthase  23.16 
 
 		 350 aa  57  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0497366  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2108  methionine synthase  23.31 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.112744  normal  0.0912449 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0981  methionine synthase vitamin-B12 independent  22.35 
 
 		 393 aa  53.5  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5820  Methionine synthase vitamin-B12 independent  22.94 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.392769 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1089  Methionine synthase vitamin-B12 independent  25.67 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4810  methionine synthase (B12-independent)  24.48 
 
 		 370 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>