128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0167 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0167  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  100 
 
 
660 aa  1360    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3626  hypothetical protein  48.28 
 
 
454 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0712602  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3492  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  50.43 
 
 
491 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0309662  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1222  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  50.88 
 
 
456 aa  100  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.633545  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1636  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  50.88 
 
 
448 aa  99  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1692  hypothetical protein  50.88 
 
 
448 aa  99  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0282  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  45.45 
 
 
344 aa  97.4  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271533  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2711  tRNA(Ile)-lysidine synthase  50.55 
 
 
371 aa  95.9  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.658001  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3197  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.33 
 
 
492 aa  93.6  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3168  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.94 
 
 
446 aa  91.7  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6875  tRNA(Ile)-lysidine synthase  47.47 
 
 
358 aa  90.5  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487527  normal  0.0484276 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4334  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  44.55 
 
 
345 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.114566 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3507  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  48.35 
 
 
345 aa  86.3  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381977  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3637  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  47.92 
 
 
400 aa  83.6  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.845838  normal  0.200954 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2624  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  49.57 
 
 
453 aa  80.5  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5490  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.75 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4142  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  50.51 
 
 
347 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4744  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  46.15 
 
 
346 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1316  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  48.35 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5309  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.97 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3082  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  48.35 
 
 
368 aa  73.9  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2319  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  44.09 
 
 
412 aa  73.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.074868  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4841  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.25 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0339142  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5387  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.33 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0565  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.01 
 
 
412 aa  71.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0666  cell cycle protein  42.55 
 
 
412 aa  70.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2362  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  37.17 
 
 
430 aa  67  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0779  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  48.35 
 
 
377 aa  65.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0526339 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1114  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.17 
 
 
417 aa  65.1  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0822323  normal  0.384948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1817  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  44.14 
 
 
346 aa  64.7  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19753  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0365  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.67 
 
 
390 aa  63.5  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0077  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  40.21 
 
 
326 aa  62.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1097  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.64 
 
 
434 aa  61.2  0.00000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0878  cell cycle protein MesJ  36.36 
 
 
433 aa  59.7  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0689  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.38 
 
 
409 aa  59.7  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0266  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.74 
 
 
464 aa  59.3  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2125  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.6 
 
 
443 aa  58.2  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.378443  normal  0.301003 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1097  PP-loop protein  31.34 
 
 
462 aa  57.8  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.873661  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1254  cell cycle protein MesJ, putative  37.08 
 
 
431 aa  57.4  0.0000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1551  cell cycle protein mesJ, putative  34.62 
 
 
455 aa  57  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1118  hypothetical protein  34.62 
 
 
442 aa  57  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2413  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.46 
 
 
450 aa  57  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1464  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.2 
 
 
464 aa  55.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.727377  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1179  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.2 
 
 
464 aa  55.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34468  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1598  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  38 
 
 
284 aa  55.1  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.331107 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0207  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.19 
 
 
423 aa  54.7  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.716943  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1360  PP-loop  34.62 
 
 
445 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1088  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  43.55 
 
 
487 aa  54.3  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00200666  normal  0.0296865 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3087  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.58 
 
 
325 aa  53.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17280  hypothetical protein  33.86 
 
 
442 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31371  predicted protein  32.97 
 
 
484 aa  53.5  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4169  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.53 
 
 
427 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1618  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  48.89 
 
 
524 aa  53.9  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0950801 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1341  hypothetical protein  34.09 
 
 
460 aa  52.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.181704  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0083  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.42 
 
 
481 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24629  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3036  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.48 
 
 
440 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244601 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1608  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  44.83 
 
 
427 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4424  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  44.23 
 
 
455 aa  52  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3342  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.48 
 
 
439 aa  51.6  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2323  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.67 
 
 
347 aa  51.2  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.368291  hitchhiker  0.0000894002 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38820  PP-loop-tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.19 
 
 
435 aa  50.8  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.96 
 
 
388 aa  50.8  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0978  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  33.03 
 
 
422 aa  50.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0172584  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2861  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  41.67 
 
 
326 aa  50.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2890  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.03 
 
 
328 aa  50.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454337  normal  0.0327552 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1627  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.67 
 
 
335 aa  50.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1467  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26 
 
 
338 aa  50.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0235653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1501  hypothetical protein  40.96 
 
 
439 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0158  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.58 
 
 
457 aa  50.4  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0865096  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0014  hypothetical protein  28.72 
 
 
401 aa  49.7  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.709368  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0959  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.08 
 
 
425 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0918  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.97 
 
 
445 aa  49.3  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1786  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.63 
 
 
321 aa  49.7  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2510  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.33 
 
 
319 aa  49.3  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336339  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8428  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.33 
 
 
358 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1626  PP-loop family protein  31.16 
 
 
321 aa  48.9  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2027  ketose-bisphosphate aldolase, class-II  30.22 
 
 
357 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.481135  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0294  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.93 
 
 
433 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.212762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1163  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.5 
 
 
427 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114234  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2662  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.23 
 
 
474 aa  48.5  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0298541 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0849  tRNA(Ile)-lysidine synthase  34.29 
 
 
442 aa  48.5  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1352  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  40 
 
 
320 aa  48.5  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150129  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1446  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.63 
 
 
321 aa  48.5  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2989  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.11 
 
 
384 aa  48.5  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1208  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.66 
 
 
438 aa  48.5  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.429523  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1842  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.73 
 
 
445 aa  48.1  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.2555  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1671  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  48.89 
 
 
455 aa  47.8  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4968  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.82 
 
 
334 aa  47.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.295349 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1620  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.07 
 
 
390 aa  47.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4065  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.88 
 
 
426 aa  47.4  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000422892 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00114  PP-loop family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11880)  33.67 
 
 
609 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0831  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.36 
 
 
344 aa  47  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2087  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  40 
 
 
335 aa  47  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.379803  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  42.86 
 
 
464 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0275  tRNA(Ile)-lysidine synthetase, MesJ  33.33 
 
 
431 aa  46.6  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.538522 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4939  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.33 
 
 
308 aa  46.6  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.457595 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1442  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  45.61 
 
 
440 aa  47  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0475  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.85 
 
 
449 aa  47  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0068  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.69 
 
 
480 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.552857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1692  tRNA(Ile)-lysidine synthase  26.85 
 
 
449 aa  46.6  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>