85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1411 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1411  high light inducible protein  100 
 
 
59 aa  121  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2818  high light inducible protein  81.36 
 
 
59 aa  102  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112403  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  74.47 
 
 
55 aa  80.5  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.941002  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3554  high light inducible protein  59.32 
 
 
59 aa  75.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0320  ferrochelatase  66.67 
 
 
387 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0327  ferrochelatase  66.67 
 
 
387 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1980  CAB/ELIP/HLIP superfamily  64.44 
 
 
46 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.741013 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2167  ferrochelatase  69.05 
 
 
387 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.261467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1574  ferrochelatase  60.47 
 
 
388 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4313  ferrochelatase  61.9 
 
 
387 aa  61.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2095  ferrochelatase  57.14 
 
 
387 aa  58.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0137  ferrochelatase  59.52 
 
 
387 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746072  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0716  ferrochelatase  55.56 
 
 
391 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4300  hypothetical protein  48.21 
 
 
66 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2916  high light inducible protein  55.32 
 
 
72 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000194255  normal  0.0166899 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1643  ferrochelatase  51.11 
 
 
391 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0066  high light inducible protein-like  50 
 
 
91 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00761  high light inducible protein  45.61 
 
 
91 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00751  high light inducible protein  45.45 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05811  ferrochelatase  53.33 
 
 
391 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0862606  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05511  ferrochelatase  53.33 
 
 
391 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0525  ferrochelatase  51.11 
 
 
391 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.703212  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0636  high light inducible protein  60.98 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05891  ferrochelatase  53.33 
 
 
391 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.979598  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07661  ferrochelatase  53.33 
 
 
391 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0342613 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0869  high light inducible protein  56.52 
 
 
67 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0943019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0868  high light inducible protein  72.73 
 
 
67 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1790  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  62.86 
 
 
67 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.45379  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1726  hypothetical protein  66.67 
 
 
61 aa  50.4  0.000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0243  high light inducible polypeptide HliC  50 
 
 
47 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.331677  normal  0.425613 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00731  high light inducible protein  39.66 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1966  CAB/ELIP/HLIP family protein  50 
 
 
47 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123276  normal  0.112404 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0847  CAB/ELIP/HLIP family protein  47.83 
 
 
47 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05281  ferrochelatase  46.67 
 
 
391 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0874  high intensity light-inducible lhc-like protein  47.83 
 
 
47 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06721  high light inducible protein  60 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1759  CAB/ELIP/HLIP-related protein  41.51 
 
 
67 aa  48.9  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1270  hypothetical protein  54.35 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.516998  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01611  high light inducible protein  51.06 
 
 
48 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1459  high light inducible protein  51.06 
 
 
48 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1857  ferrochelatase  48.89 
 
 
391 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.89761  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4587  high light inducible protein  66.67 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.47687  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1997  high light-inducible protein  53.06 
 
 
72 aa  47.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05261  high light inducible protein  51.11 
 
 
60 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205192  normal  0.0894191 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05821  ferrochelatase  48.89 
 
 
391 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01041  high light inducible protein  62.86 
 
 
48 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.163398  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04711  high light inducible protein  60 
 
 
58 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0492452  normal  0.922035 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4043  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  45.65 
 
 
47 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1120  hypothetical protein  53.66 
 
 
51 aa  45.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2265  high light inducible protein  40.35 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.594666 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01091  high light inducible protein  46.81 
 
 
48 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.401748  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16041  putative high light inducible protein  42.55 
 
 
50 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1803  high light inducible protein hli9  55.56 
 
 
60 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.946292  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0097  high light inducible protein-like  46.81 
 
 
48 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.108221  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16731  putative high light inducible protein  46.81 
 
 
50 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16861  putative high light inducible protein  46.81 
 
 
50 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16621  putative high light inducible protein  46.81 
 
 
50 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0646927  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5010  high light inducible protein  42.55 
 
 
71 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04401  putative high light inducible protein  36.17 
 
 
50 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02401  hypothetical protein  44.44 
 
 
48 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0155  hypothetical protein  54.29 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0368  high light inducible protein  48.84 
 
 
46 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3021  protein of the CAB/ELIP/HLIP superfamily  57.58 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219855  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1000  high light inducible protein  46.51 
 
 
45 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.282827  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01051  high light inducible protein  44.68 
 
 
48 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.127932  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2720  CAB/ELIP/HLIP-related protein  55 
 
 
54 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556008  hitchhiker  0.0000310202 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1575  putative high light inducible protein  46.81 
 
 
50 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2576  hypothetical protein  46.34 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.783641  normal  0.106998 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2542  hypothetical protein  43.75 
 
 
70 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0415  high light inducible protein  47.5 
 
 
69 aa  41.6  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2323  high light inducible protein  46.51 
 
 
46 aa  41.6  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.647377 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01081  high light inducible protein  48.84 
 
 
48 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0471  high light inducible protein-like  72.73 
 
 
58 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0529885  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0608  putative high light inducible protein  38.3 
 
 
50 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131116  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04961  high light inducible protein  52.94 
 
 
59 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1282  hypothetical protein  51.28 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1831  high light inducible protein  38.33 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05261  high light inducible protein  72.73 
 
 
58 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1013  putative high light inducible protein  42.55 
 
 
50 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18831  putative high light inducible protein  42.55 
 
 
50 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0672  CAB/ELIP/HLIP-related protein  45 
 
 
58 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0691  HLIP; single helix LHC light protein  45 
 
 
58 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000595991  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1910  CAB/ELIP/HLIP-related protein  47.5 
 
 
56 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0846233  normal  0.275472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2057  CAB/ELIP/HLIP-related protein  34.48 
 
 
59 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0175  CAB/ELIP/HLIP-related protein  37.04 
 
 
56 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000121153  normal  0.0293662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>