19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0636 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0636  high light inducible protein  100 
 
 
67 aa  136  8.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1726  hypothetical protein  74.07 
 
 
61 aa  84  6e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06721  high light inducible protein  63.46 
 
 
67 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04711  high light inducible protein  60.42 
 
 
58 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0492452  normal  0.922035 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1270  hypothetical protein  57.45 
 
 
98 aa  60.5  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.516998  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05261  high light inducible protein  55.81 
 
 
60 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205192  normal  0.0894191 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0471  high light inducible protein-like  75 
 
 
58 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0529885  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1411  high light inducible protein  60.98 
 
 
59 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1803  high light inducible protein hli9  55.81 
 
 
60 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.946292  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04961  high light inducible protein  55.81 
 
 
59 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05261  high light inducible protein  55.81 
 
 
58 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  57.5 
 
 
55 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.941002  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05351  high light inducible protein  64.52 
 
 
60 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2818  high light inducible protein  51.92 
 
 
59 aa  49.7  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112403  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0869  high light inducible protein  55.56 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0943019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1790  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  48.89 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.45379  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0868  high light inducible protein  76 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05891  ferrochelatase  35.09 
 
 
391 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.979598  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4587  high light inducible protein  51.11 
 
 
67 aa  40.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.47687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>