19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1790 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1790  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  100 
 
 
67 aa  140  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.45379  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0868  high light inducible protein  83.58 
 
 
67 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4587  high light inducible protein  80.6 
 
 
67 aa  121  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.47687  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0869  high light inducible protein  80.6 
 
 
67 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0943019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3021  protein of the CAB/ELIP/HLIP superfamily  76 
 
 
68 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219855  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  74.19 
 
 
55 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.941002  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2818  high light inducible protein  50.98 
 
 
59 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112403  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1411  high light inducible protein  62.86 
 
 
59 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1270  hypothetical protein  42.11 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.516998  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0066  high light inducible protein-like  50 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4300  hypothetical protein  45.28 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0636  high light inducible protein  48.89 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1282  hypothetical protein  74.07 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06721  high light inducible protein  42.22 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00751  high light inducible protein  48.48 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3554  high light inducible protein  56.25 
 
 
59 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2265  high light inducible protein  42.31 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.594666 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03161  high light inducible protein  45.16 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.906124 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04711  high light inducible protein  37.78 
 
 
58 aa  40  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0492452  normal  0.922035 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>