54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1282 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1282  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  76.19 
 
 
58 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00731  high light inducible protein  43.08 
 
 
77 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2265  high light inducible protein  50.77 
 
 
66 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.594666 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01281  high light inducible protein  46.97 
 
 
79 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0214149  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0415  high light inducible protein  44.78 
 
 
69 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00721  high light inducible protein  46.55 
 
 
82 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.624875 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03161  high light inducible protein  60.98 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.906124 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0066  high light inducible protein-like  55 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2057  CAB/ELIP/HLIP-related protein  44.83 
 
 
59 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519028 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00751  high light inducible protein  52.5 
 
 
91 aa  57.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00761  high light inducible protein  55 
 
 
91 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0175  CAB/ELIP/HLIP-related protein  43.1 
 
 
56 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000121153  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0691  HLIP; single helix LHC light protein  41.38 
 
 
58 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000595991  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0672  CAB/ELIP/HLIP-related protein  41.38 
 
 
58 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0155  hypothetical protein  46.81 
 
 
94 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1910  CAB/ELIP/HLIP-related protein  46.3 
 
 
56 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0846233  normal  0.275472 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3583  CAB/ELIP/HLIP-like protein  43.1 
 
 
56 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2720  CAB/ELIP/HLIP-related protein  50 
 
 
54 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556008  hitchhiker  0.0000310202 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1427  high light inducible protein hli5  45.45 
 
 
79 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4300  hypothetical protein  61.54 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2542  hypothetical protein  44.68 
 
 
70 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0243  high light inducible polypeptide HliC  53.33 
 
 
47 aa  47.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.331677  normal  0.425613 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1759  CAB/ELIP/HLIP-related protein  44 
 
 
67 aa  47  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1013  putative high light inducible protein  44.9 
 
 
50 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18831  putative high light inducible protein  44.9 
 
 
50 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5010  high light inducible protein  63.33 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0608  putative high light inducible protein  40.82 
 
 
50 aa  44.7  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131116  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2916  high light inducible protein  63.33 
 
 
72 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000194255  normal  0.0166899 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2064  hypothetical protein  38.78 
 
 
63 aa  43.5  0.0009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0330706  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1574  ferrochelatase  56.41 
 
 
388 aa  42.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1980  CAB/ELIP/HLIP superfamily  61.29 
 
 
46 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.741013 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16621  putative high light inducible protein  42 
 
 
50 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0646927  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16861  putative high light inducible protein  42 
 
 
50 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04401  putative high light inducible protein  41.03 
 
 
50 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3554  high light inducible protein  41.51 
 
 
59 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01041  high light inducible protein  44.44 
 
 
48 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.163398  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16041  putative high light inducible protein  41.46 
 
 
50 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1790  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  74.07 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.45379  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14781  high light inducible protein  51.52 
 
 
92 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15031  high light inducible protein  51.52 
 
 
81 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1414  high light inducible protein-like  51.52 
 
 
81 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.680759  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1411  high light inducible protein  51.28 
 
 
59 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15161  high light inducible protein  48.48 
 
 
81 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.163919  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2167  ferrochelatase  56.41 
 
 
387 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.261467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0847  CAB/ELIP/HLIP family protein  48.78 
 
 
47 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16731  putative high light inducible protein  44.44 
 
 
50 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0874  high intensity light-inducible lhc-like protein  48.78 
 
 
47 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01081  high light inducible protein  45.65 
 
 
48 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2818  high light inducible protein  44 
 
 
59 aa  40.8  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112403  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1000  high light inducible protein  51.22 
 
 
45 aa  40.8  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.282827  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01051  high light inducible protein  45.65 
 
 
48 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.127932  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2576  hypothetical protein  44.19 
 
 
66 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.783641  normal  0.106998 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0368  high light inducible protein  53.85 
 
 
46 aa  40  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>