49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2576 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2576  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  135  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.783641  normal  0.106998 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1000  high light inducible protein  86.05 
 
 		 45 aa  77  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.282827  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0368  high light inducible protein  76.74 
 
 		 46 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22638  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0243  high light inducible polypeptide HliC  76.19 
 
 		 47 aa  74.3  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.331677  normal  0.425613 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2323  high light inducible protein  76.74 
 
 		 46 aa  73.6  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.647377 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1966  CAB/ELIP/HLIP family protein  73.33 
 
 		 47 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123276  normal  0.112404 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01091  high light inducible protein  68.09 
 
 		 48 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.401748  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02401  hypothetical protein  69.57 
 
 		 48 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0097  high light inducible protein-like  68.09 
 
 		 48 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.108221  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0847  CAB/ELIP/HLIP family protein  68.89 
 
 		 47 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0874  high intensity light-inducible lhc-like protein  68.89 
 
 		 47 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4043  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  64.44 
 
 		 47 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01051  high light inducible protein  65.96 
 
 		 48 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.127932  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01081  high light inducible protein  65.96 
 
 		 48 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01611  high light inducible protein  65.22 
 
 		 48 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1459  high light inducible protein  65.22 
 
 		 48 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01041  high light inducible protein  61.36 
 
 		 48 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1120  hypothetical protein  62.22 
 
 		 51 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1980  CAB/ELIP/HLIP superfamily  64.86 
 
 		 46 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.741013 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0672  CAB/ELIP/HLIP-related protein  57.14 
 
 		 58 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0691  HLIP; single helix LHC light protein  57.14 
 
 		 58 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000595991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2720  CAB/ELIP/HLIP-related protein  57.14 
 
 		 54 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556008  hitchhiker  0.0000310202 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5010  high light inducible protein  43.64 
 
 		 71 aa  50.4  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1910  CAB/ELIP/HLIP-related protein  50 
 
 		 56 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0846233  normal  0.275472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1574  ferrochelatase  55 
 
 		 388 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  56.41 
 
 		 55 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.941002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2057  CAB/ELIP/HLIP-related protein  52.38 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2916  high light inducible protein  45.1 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000194255  normal  0.0166899 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2095  ferrochelatase  52.5 
 
 		 387 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3583  CAB/ELIP/HLIP-like protein  47.62 
 
 		 56 aa  45.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0175  CAB/ELIP/HLIP-related protein  47.62 
 
 		 56 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000121153  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1756  high light inducible protein  61.76 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.540799  normal  0.134694 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2568  putative high light inducible protein  61.76 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.977203 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1997  high light-inducible protein  38.98 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11191  high light inducible protein  56.67 
 
 		 45 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0137  ferrochelatase  47.5 
 
 		 387 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746072  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0320  ferrochelatase  47.5 
 
 		 387 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2167  ferrochelatase  47.5 
 
 		 387 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.261467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1411  high light inducible protein  46.34 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0327  ferrochelatase  47.5 
 
 		 387 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0155  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4300  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2222  putative high light inducible protein  60.61 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2542  hypothetical protein  38.89 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2818  high light inducible protein  51.43 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112403  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1282  hypothetical protein  44.19 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4313  ferrochelatase  47.5 
 
 		 387 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0716  ferrochelatase  45 
 
 		 391 aa  40  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  42.86 
 
 		 58 aa  40  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>