39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2323 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2323  high light inducible protein  100 
 
 		 46 aa  90.5  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.647377 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0368  high light inducible protein  95.65 
 
 		 46 aa  87.8  5e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22638  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02401  hypothetical protein  79.17 
 
 		 48 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01081  high light inducible protein  75.56 
 
 		 48 aa  73.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0097  high light inducible protein-like  75.56 
 
 		 48 aa  73.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.108221  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01051  high light inducible protein  75.56 
 
 		 48 aa  73.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.127932  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01091  high light inducible protein  75.56 
 
 		 48 aa  73.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.401748  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2576  hypothetical protein  76.74 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.783641  normal  0.106998 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1000  high light inducible protein  77.27 
 
 		 45 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.282827  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01611  high light inducible protein  75 
 
 		 48 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1459  high light inducible protein  75 
 
 		 48 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0243  high light inducible polypeptide HliC  77.27 
 
 		 47 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.331677  normal  0.425613 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01041  high light inducible protein  72.92 
 
 		 48 aa  70.1  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1966  CAB/ELIP/HLIP family protein  72.73 
 
 		 47 aa  67.8  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123276  normal  0.112404 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0847  CAB/ELIP/HLIP family protein  68.18 
 
 		 47 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0874  high intensity light-inducible lhc-like protein  68.18 
 
 		 47 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4043  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  75 
 
 		 47 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1120  hypothetical protein  60.47 
 
 		 51 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1980  CAB/ELIP/HLIP superfamily  53.66 
 
 		 46 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.741013 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0672  CAB/ELIP/HLIP-related protein  53.49 
 
 		 58 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0691  HLIP; single helix LHC light protein  53.49 
 
 		 58 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000595991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1910  CAB/ELIP/HLIP-related protein  51.16 
 
 		 56 aa  47.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0846233  normal  0.275472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2720  CAB/ELIP/HLIP-related protein  57.14 
 
 		 54 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556008  hitchhiker  0.0000310202 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1574  ferrochelatase  58.97 
 
 		 388 aa  47  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2568  putative high light inducible protein  73.53 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.977203 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2057  CAB/ELIP/HLIP-related protein  51.16 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519028 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  58.97 
 
 		 55 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.941002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2222  putative high light inducible protein  72.73 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1759  CAB/ELIP/HLIP-related protein  51.16 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2095  ferrochelatase  51.28 
 
 		 387 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1756  high light inducible protein  55.81 
 
 		 65 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.540799  normal  0.134694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1411  high light inducible protein  46.51 
 
 		 59 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0175  CAB/ELIP/HLIP-related protein  44.19 
 
 		 56 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000121153  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0137  ferrochelatase  60.61 
 
 		 387 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746072  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0327  ferrochelatase  50 
 
 		 387 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0320  ferrochelatase  50 
 
 		 387 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3583  CAB/ELIP/HLIP-like protein  41.86 
 
 		 56 aa  40.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2167  ferrochelatase  51.28 
 
 		 387 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.261467 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2818  high light inducible protein  50 
 
 		 59 aa  40  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>