18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2222 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2222  putative high light inducible protein  100 
 
 		 78 aa  162  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2568  putative high light inducible protein  82.05 
 
 		 78 aa  140  6e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.977203 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1756  high light inducible protein  56.67 
 
 		 65 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.540799  normal  0.134694 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1120  hypothetical protein  61.76 
 
 		 51 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2323  high light inducible protein  72.73 
 
 		 46 aa  44.3  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.647377 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1966  CAB/ELIP/HLIP family protein  68.75 
 
 		 47 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123276  normal  0.112404 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0368  high light inducible protein  69.7 
 
 		 46 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22638  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1000  high light inducible protein  63.64 
 
 		 45 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.282827  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1459  high light inducible protein  60.61 
 
 		 48 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01611  high light inducible protein  60.61 
 
 		 48 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0874  high intensity light-inducible lhc-like protein  62.5 
 
 		 47 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4043  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  68.75 
 
 		 47 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0847  CAB/ELIP/HLIP family protein  62.5 
 
 		 47 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2576  hypothetical protein  60.61 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.783641  normal  0.106998 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02401  hypothetical protein  60.61 
 
 		 48 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01041  high light inducible protein  60.61 
 
 		 48 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0243  high light inducible polypeptide HliC  62.5 
 
 		 47 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.331677  normal  0.425613 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1030  high light inducible protein  50 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.182969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>