22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1756 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1756  high light inducible protein  100 
 
 		 65 aa  134  4e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.540799  normal  0.134694 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2222  putative high light inducible protein  56.67 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2568  putative high light inducible protein  53.33 
 
 		 78 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.977203 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1030  high light inducible protein  46.43 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.182969  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1966  CAB/ELIP/HLIP family protein  63.64 
 
 		 47 aa  45.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123276  normal  0.112404 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0243  high light inducible polypeptide HliC  74.19 
 
 		 47 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.331677  normal  0.425613 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01041  high light inducible protein  64.71 
 
 		 48 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0874  high intensity light-inducible lhc-like protein  61.29 
 
 		 47 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0847  CAB/ELIP/HLIP family protein  61.29 
 
 		 47 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2576  hypothetical protein  61.76 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.783641  normal  0.106998 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0368  high light inducible protein  55.81 
 
 		 46 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22638  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0672  CAB/ELIP/HLIP-related protein  41.18 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0691  HLIP; single helix LHC light protein  41.18 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000595991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1120  hypothetical protein  59.38 
 
 		 51 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2323  high light inducible protein  55.81 
 
 		 46 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.647377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4043  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  61.29 
 
 		 47 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2057  CAB/ELIP/HLIP-related protein  42.55 
 
 		 59 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519028 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0155  hypothetical protein  55.88 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01611  high light inducible protein  52.94 
 
 		 48 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1459  high light inducible protein  52.94 
 
 		 48 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2542  hypothetical protein  67.74 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2720  CAB/ELIP/HLIP-related protein  61.29 
 
 		 54 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556008  hitchhiker  0.0000310202 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>