44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_01611 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_01611  high light inducible protein  100 
 
 
48 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1459  high light inducible protein  100 
 
 
48 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02401  hypothetical protein  75 
 
 
48 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01041  high light inducible protein  77.08 
 
 
48 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.163398  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01091  high light inducible protein  75 
 
 
48 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.401748  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0097  high light inducible protein-like  75 
 
 
48 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.108221  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01081  high light inducible protein  78.72 
 
 
48 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01051  high light inducible protein  72.92 
 
 
48 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.127932  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2323  high light inducible protein  75 
 
 
46 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.647377 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0368  high light inducible protein  75 
 
 
46 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22638  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2576  hypothetical protein  65.22 
 
 
66 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.783641  normal  0.106998 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1966  CAB/ELIP/HLIP family protein  66.67 
 
 
47 aa  66.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123276  normal  0.112404 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1000  high light inducible protein  67.44 
 
 
45 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.282827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0243  high light inducible polypeptide HliC  65.85 
 
 
47 aa  61.6  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.331677  normal  0.425613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4043  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  64.29 
 
 
47 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0847  CAB/ELIP/HLIP family protein  59.52 
 
 
47 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0874  high intensity light-inducible lhc-like protein  59.52 
 
 
47 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1120  hypothetical protein  61.7 
 
 
51 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2720  CAB/ELIP/HLIP-related protein  54.76 
 
 
54 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556008  hitchhiker  0.0000310202 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1980  CAB/ELIP/HLIP superfamily  53.85 
 
 
46 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.741013 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1411  high light inducible protein  51.06 
 
 
59 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0672  CAB/ELIP/HLIP-related protein  47.62 
 
 
58 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0691  HLIP; single helix LHC light protein  47.62 
 
 
58 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000595991  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1574  ferrochelatase  51.28 
 
 
388 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2818  high light inducible protein  57.5 
 
 
59 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112403  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2057  CAB/ELIP/HLIP-related protein  47.62 
 
 
59 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519028 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  53.85 
 
 
55 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.941002  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1910  CAB/ELIP/HLIP-related protein  45.24 
 
 
56 aa  44.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0846233  normal  0.275472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2568  putative high light inducible protein  61.76 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.977203 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2222  putative high light inducible protein  60.61 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0175  CAB/ELIP/HLIP-related protein  45.24 
 
 
56 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000121153  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0137  ferrochelatase  51.28 
 
 
387 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746072  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0320  ferrochelatase  47.5 
 
 
387 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0327  ferrochelatase  47.5 
 
 
387 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3583  CAB/ELIP/HLIP-like protein  42.86 
 
 
56 aa  41.2  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2095  ferrochelatase  48.72 
 
 
387 aa  40.8  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05891  ferrochelatase  47.5 
 
 
391 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.979598  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1756  high light inducible protein  52.94 
 
 
65 aa  40.8  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.540799  normal  0.134694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4300  hypothetical protein  57.58 
 
 
66 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2167  ferrochelatase  48.72 
 
 
387 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.261467 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0155  hypothetical protein  47.22 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0716  ferrochelatase  46.15 
 
 
391 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05511  ferrochelatase  45 
 
 
391 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05811  ferrochelatase  45 
 
 
391 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0862606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>