32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0097 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0097  high light inducible protein-like  100 
 
 		 48 aa  97.1  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.108221  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01091  high light inducible protein  100 
 
 		 48 aa  97.1  7e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.401748  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01051  high light inducible protein  95.83 
 
 		 48 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.127932  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01081  high light inducible protein  95.83 
 
 		 48 aa  93.6  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02401  hypothetical protein  77.08 
 
 		 48 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1459  high light inducible protein  75 
 
 		 48 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01611  high light inducible protein  75 
 
 		 48 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2323  high light inducible protein  75.56 
 
 		 46 aa  73.6  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.647377 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0368  high light inducible protein  73.33 
 
 		 46 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22638  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2576  hypothetical protein  68.09 
 
 		 66 aa  70.5  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.783641  normal  0.106998 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01041  high light inducible protein  66.67 
 
 		 48 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1000  high light inducible protein  70.45 
 
 		 45 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.282827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0243  high light inducible polypeptide HliC  62.22 
 
 		 47 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.331677  normal  0.425613 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1966  CAB/ELIP/HLIP family protein  60 
 
 		 47 aa  63.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123276  normal  0.112404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4043  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  53.33 
 
 		 47 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0847  CAB/ELIP/HLIP family protein  53.33 
 
 		 47 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0874  high intensity light-inducible lhc-like protein  53.33 
 
 		 47 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1120  hypothetical protein  59.18 
 
 		 51 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1980  CAB/ELIP/HLIP superfamily  51.16 
 
 		 46 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.741013 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2057  CAB/ELIP/HLIP-related protein  48.84 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519028 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2720  CAB/ELIP/HLIP-related protein  52.38 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556008  hitchhiker  0.0000310202 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1411  high light inducible protein  46.81 
 
 		 59 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0672  CAB/ELIP/HLIP-related protein  44.19 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1910  CAB/ELIP/HLIP-related protein  41.86 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0846233  normal  0.275472 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0691  HLIP; single helix LHC light protein  44.19 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000595991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1574  ferrochelatase  51.28 
 
 		 388 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  43.48 
 
 		 55 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.941002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2818  high light inducible protein  48.89 
 
 		 59 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112403  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11191  high light inducible protein  58.62 
 
 		 45 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2568  putative high light inducible protein  58.82 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.977203 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2095  ferrochelatase  42.55 
 
 		 387 aa  40.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0066  high light inducible protein-like  43.18 
 
 		 91 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>