62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1980 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1980  CAB/ELIP/HLIP superfamily  100 
 
 		 46 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.741013 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1411  high light inducible protein  64.44 
 
 		 59 aa  64.3  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2818  high light inducible protein  64.44 
 
 		 59 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112403  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  65 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.941002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1574  ferrochelatase  68.29 
 
 		 388 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3554  high light inducible protein  56.82 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0243  high light inducible polypeptide HliC  62.5 
 
 		 47 aa  57  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.331677  normal  0.425613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2167  ferrochelatase  65.85 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.261467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0320  ferrochelatase  63.41 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0327  ferrochelatase  63.41 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1000  high light inducible protein  64.1 
 
 		 45 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.282827  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4043  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  61.54 
 
 		 47 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2576  hypothetical protein  64.86 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.783641  normal  0.106998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0847  CAB/ELIP/HLIP family protein  60 
 
 		 47 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0874  high intensity light-inducible lhc-like protein  60 
 
 		 47 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2095  ferrochelatase  66.67 
 
 		 387 aa  53.9  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1966  CAB/ELIP/HLIP family protein  57.5 
 
 		 47 aa  53.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123276  normal  0.112404 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4313  ferrochelatase  58.54 
 
 		 387 aa  53.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0368  high light inducible protein  57.5 
 
 		 46 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2720  CAB/ELIP/HLIP-related protein  59.52 
 
 		 54 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556008  hitchhiker  0.0000310202 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4300  hypothetical protein  62.5 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0716  ferrochelatase  53.66 
 
 		 391 aa  50.4  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2323  high light inducible protein  53.66 
 
 		 46 aa  50.1  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.647377 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01611  high light inducible protein  53.85 
 
 		 48 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0691  HLIP; single helix LHC light protein  57.89 
 
 		 58 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000595991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1459  high light inducible protein  53.85 
 
 		 48 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0672  CAB/ELIP/HLIP-related protein  57.89 
 
 		 58 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01041  high light inducible protein  53.85 
 
 		 48 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01051  high light inducible protein  53.49 
 
 		 48 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.127932  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01081  high light inducible protein  53.49 
 
 		 48 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2057  CAB/ELIP/HLIP-related protein  53.49 
 
 		 59 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519028 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01091  high light inducible protein  51.16 
 
 		 48 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.401748  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0097  high light inducible protein-like  51.16 
 
 		 48 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.108221  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0137  ferrochelatase  53.66 
 
 		 387 aa  47.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746072  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02401  hypothetical protein  50 
 
 		 48 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1643  ferrochelatase  48.78 
 
 		 391 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07661  ferrochelatase  48.78 
 
 		 391 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0342613 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0155  hypothetical protein  47.5 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1120  hypothetical protein  50 
 
 		 51 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1910  CAB/ELIP/HLIP-related protein  55.26 
 
 		 56 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0846233  normal  0.275472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2916  high light inducible protein  50 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000194255  normal  0.0166899 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1726  hypothetical protein  63.64 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0066  high light inducible protein-like  46.34 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1282  hypothetical protein  61.29 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2542  hypothetical protein  43.9 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1997  high light-inducible protein  56.41 
 
 		 72 aa  42.7  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03161  high light inducible protein  47.73 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.906124 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05811  ferrochelatase  55.56 
 
 		 391 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0862606  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0175  CAB/ELIP/HLIP-related protein  46.51 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000121153  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05891  ferrochelatase  55.56 
 
 		 391 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.979598  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3583  CAB/ELIP/HLIP-like protein  50 
 
 		 56 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00751  high light inducible protein  46.34 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05511  ferrochelatase  55.56 
 
 		 391 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2265  high light inducible protein  44.44 
 
 		 66 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.594666 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5010  high light inducible protein  50 
 
 		 71 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0525  ferrochelatase  52.78 
 
 		 391 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.703212  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00761  high light inducible protein  46.34 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05281  ferrochelatase  48.78 
 
 		 391 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16041  putative high light inducible protein  52.78 
 
 		 50 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00731  high light inducible protein  44.44 
 
 		 77 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1759  CAB/ELIP/HLIP-related protein  40 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0415  high light inducible protein  45 
 
 		 69 aa  40  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>