16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1726 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1726  hypothetical protein  100 
 
 
61 aa  124  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0636  high light inducible protein  74.07 
 
 
67 aa  84  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06721  high light inducible protein  69.77 
 
 
67 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04711  high light inducible protein  53.57 
 
 
58 aa  62  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0492452  normal  0.922035 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05261  high light inducible protein  62.79 
 
 
60 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205192  normal  0.0894191 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1270  hypothetical protein  68.42 
 
 
98 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.516998  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1803  high light inducible protein hli9  54 
 
 
60 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.946292  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05261  high light inducible protein  66.67 
 
 
58 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04961  high light inducible protein  66.67 
 
 
59 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1411  high light inducible protein  66.67 
 
 
59 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0471  high light inducible protein-like  75 
 
 
58 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0529885  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05351  high light inducible protein  70 
 
 
60 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2818  high light inducible protein  52.08 
 
 
59 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112403  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  52.63 
 
 
55 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.941002  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1980  CAB/ELIP/HLIP superfamily  63.64 
 
 
46 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.741013 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0868  high light inducible protein  70.37 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0947788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>