16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1270 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1270  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  201  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.516998  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0636  high light inducible protein  57.45 
 
 
67 aa  60.5  0.000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05261  high light inducible protein  57.45 
 
 
60 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205192  normal  0.0894191 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04711  high light inducible protein  58.54 
 
 
58 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0492452  normal  0.922035 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1726  hypothetical protein  68.42 
 
 
61 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06721  high light inducible protein  59.57 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1803  high light inducible protein hli9  65.71 
 
 
60 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.946292  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04961  high light inducible protein  75.86 
 
 
59 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05351  high light inducible protein  58.33 
 
 
60 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0471  high light inducible protein-like  72.41 
 
 
58 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0529885  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05261  high light inducible protein  61.76 
 
 
58 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1411  high light inducible protein  54.35 
 
 
59 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  58.97 
 
 
55 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.941002  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2818  high light inducible protein  51.06 
 
 
59 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112403  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1790  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  42.11 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.45379  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0868  high light inducible protein  44.64 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0947788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>