18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0868 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0868  high light inducible protein  100 
 
 
67 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4587  high light inducible protein  86.57 
 
 
67 aa  127  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.47687  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0869  high light inducible protein  89.55 
 
 
67 aa  127  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0943019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1790  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  83.58 
 
 
67 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.45379  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3021  protein of the CAB/ELIP/HLIP superfamily  80.39 
 
 
68 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219855  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  80 
 
 
55 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.941002  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1411  high light inducible protein  72.73 
 
 
59 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2818  high light inducible protein  56 
 
 
59 aa  50.4  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112403  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4313  ferrochelatase  57.58 
 
 
387 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4300  hypothetical protein  44.44 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1643  ferrochelatase  51.52 
 
 
391 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00731  high light inducible protein  35.71 
 
 
77 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1270  hypothetical protein  44.64 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.516998  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0066  high light inducible protein-like  53.12 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0636  high light inducible protein  76 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0716  ferrochelatase  57.14 
 
 
391 aa  40.8  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1726  hypothetical protein  70.37 
 
 
61 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2167  ferrochelatase  52.78 
 
 
387 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.261467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>