39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_00731 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_00731  high light inducible protein  100 
 
 
77 aa  154  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0066  high light inducible protein-like  56.04 
 
 
91 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00761  high light inducible protein  59.46 
 
 
91 aa  86.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00751  high light inducible protein  50.55 
 
 
91 aa  83.6  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1282  hypothetical protein  43.08 
 
 
66 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01281  high light inducible protein  46.15 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0214149  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2265  high light inducible protein  44.07 
 
 
66 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.594666 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00721  high light inducible protein  41.77 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.624875 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03161  high light inducible protein  43.1 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.906124 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0415  high light inducible protein  52.5 
 
 
69 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  45.45 
 
 
58 aa  52.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1427  high light inducible protein hli5  46.15 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4300  hypothetical protein  37.04 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1411  high light inducible protein  39.66 
 
 
59 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1759  CAB/ELIP/HLIP-related protein  30.16 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2057  CAB/ELIP/HLIP-related protein  36.84 
 
 
59 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519028 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0691  HLIP; single helix LHC light protein  38.78 
 
 
58 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000595991  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0672  CAB/ELIP/HLIP-related protein  38.78 
 
 
58 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3554  high light inducible protein  46.81 
 
 
59 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0869  high light inducible protein  39.29 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0943019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0175  CAB/ELIP/HLIP-related protein  42.5 
 
 
56 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000121153  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2818  high light inducible protein  43.75 
 
 
59 aa  43.5  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112403  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0155  hypothetical protein  31.25 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3583  CAB/ELIP/HLIP-like protein  40 
 
 
56 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1910  CAB/ELIP/HLIP-related protein  39.53 
 
 
56 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0846233  normal  0.275472 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1414  high light inducible protein-like  46.34 
 
 
81 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.680759  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0716  ferrochelatase  42.22 
 
 
391 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  38.3 
 
 
55 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.941002  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0868  high light inducible protein  35.71 
 
 
67 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15031  high light inducible protein  46.34 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15161  high light inducible protein  46.34 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.163919  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18831  putative high light inducible protein  30.61 
 
 
50 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05891  ferrochelatase  36.62 
 
 
391 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.979598  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1013  putative high light inducible protein  30.61 
 
 
50 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2720  CAB/ELIP/HLIP-related protein  37.5 
 
 
54 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556008  hitchhiker  0.0000310202 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2916  high light inducible protein  33.33 
 
 
72 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000194255  normal  0.0166899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1980  CAB/ELIP/HLIP superfamily  44.44 
 
 
46 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.741013 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0608  putative high light inducible protein  35.42 
 
 
50 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131116  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2167  ferrochelatase  40 
 
 
387 aa  40  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.261467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>