45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0066 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0066  high light inducible protein-like  100 
 
 		 91 aa  180  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00761  high light inducible protein  81.32 
 
 		 91 aa  145  3e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00751  high light inducible protein  79.12 
 
 		 91 aa  143  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00731  high light inducible protein  56.04 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00721  high light inducible protein  44.74 
 
 		 82 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.624875 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2265  high light inducible protein  46.88 
 
 		 66 aa  70.9  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.594666 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03161  high light inducible protein  42.19 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.906124 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01281  high light inducible protein  41.76 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0214149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0415  high light inducible protein  60 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  50 
 
 		 58 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1282  hypothetical protein  55 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1411  high light inducible protein  50 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1427  high light inducible protein hli5  46.67 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3554  high light inducible protein  57.78 
 
 		 59 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2818  high light inducible protein  55.56 
 
 		 59 aa  51.6  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112403  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1759  CAB/ELIP/HLIP-related protein  33.33 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1910  CAB/ELIP/HLIP-related protein  48.84 
 
 		 56 aa  48.9  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0846233  normal  0.275472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0175  CAB/ELIP/HLIP-related protein  48.84 
 
 		 56 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000121153  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2057  CAB/ELIP/HLIP-related protein  48.84 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519028 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0691  HLIP; single helix LHC light protein  42.86 
 
 		 58 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000595991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0672  CAB/ELIP/HLIP-related protein  42.86 
 
 		 58 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3583  CAB/ELIP/HLIP-like protein  46.51 
 
 		 56 aa  47.4  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4300  hypothetical protein  36.62 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0716  ferrochelatase  46.67 
 
 		 391 aa  44.3  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  36.51 
 
 		 55 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.941002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1980  CAB/ELIP/HLIP superfamily  46.34 
 
 		 46 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.741013 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16861  putative high light inducible protein  48.65 
 
 		 50 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1790  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  50 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.45379  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2720  CAB/ELIP/HLIP-related protein  45.24 
 
 		 54 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556008  hitchhiker  0.0000310202 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16731  putative high light inducible protein  48.65 
 
 		 50 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16621  putative high light inducible protein  48.65 
 
 		 50 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0646927  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15031  high light inducible protein  43.08 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1575  putative high light inducible protein  48.65 
 
 		 50 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1643  ferrochelatase  44.44 
 
 		 391 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2916  high light inducible protein  45.71 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000194255  normal  0.0166899 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05891  ferrochelatase  48.89 
 
 		 391 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.979598  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0155  hypothetical protein  31.91 
 
 		 94 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0869  high light inducible protein  56.25 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0943019 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05811  ferrochelatase  46.67 
 
 		 391 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0862606  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0525  ferrochelatase  44.44 
 
 		 391 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.703212  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0868  high light inducible protein  53.12 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05511  ferrochelatase  46.67 
 
 		 391 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2542  hypothetical protein  29.79 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01091  high light inducible protein  43.18 
 
 		 48 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.401748  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0097  high light inducible protein-like  43.18 
 
 		 48 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.108221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>