16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0869 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0869  high light inducible protein  100 
 
 
67 aa  140  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0943019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0868  high light inducible protein  89.55 
 
 
67 aa  127  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4587  high light inducible protein  82.09 
 
 
67 aa  121  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.47687  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1790  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  80.6 
 
 
67 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.45379  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3021  protein of the CAB/ELIP/HLIP superfamily  80 
 
 
68 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219855  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  57.45 
 
 
55 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.941002  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2818  high light inducible protein  54 
 
 
59 aa  51.6  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112403  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1411  high light inducible protein  56.52 
 
 
59 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0636  high light inducible protein  55.56 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00731  high light inducible protein  39.29 
 
 
77 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4300  hypothetical protein  45.28 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1643  ferrochelatase  56.25 
 
 
391 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0716  ferrochelatase  50 
 
 
391 aa  41.6  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0066  high light inducible protein-like  56.25 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3554  high light inducible protein  64.29 
 
 
59 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2095  ferrochelatase  43.9 
 
 
387 aa  40.4  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>