44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_00751 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_00751  high light inducible protein  100 
 
 
91 aa  179  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00761  high light inducible protein  89.01 
 
 
91 aa  161  3e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0066  high light inducible protein-like  79.12 
 
 
91 aa  143  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00731  high light inducible protein  50.55 
 
 
77 aa  83.6  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2265  high light inducible protein  43.75 
 
 
66 aa  72.8  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.594666 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03161  high light inducible protein  53.06 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.906124 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00721  high light inducible protein  54 
 
 
82 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.624875 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0415  high light inducible protein  60 
 
 
69 aa  67.4  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01281  high light inducible protein  54 
 
 
79 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0214149  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  50 
 
 
58 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1282  hypothetical protein  52.5 
 
 
66 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3554  high light inducible protein  59.57 
 
 
59 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1411  high light inducible protein  45.45 
 
 
59 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1427  high light inducible protein hli5  56 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1910  CAB/ELIP/HLIP-related protein  48.84 
 
 
56 aa  50.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0846233  normal  0.275472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2057  CAB/ELIP/HLIP-related protein  48.84 
 
 
59 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0175  CAB/ELIP/HLIP-related protein  48.84 
 
 
56 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000121153  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3583  CAB/ELIP/HLIP-like protein  46.51 
 
 
56 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2818  high light inducible protein  51.06 
 
 
59 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112403  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1759  CAB/ELIP/HLIP-related protein  40 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0155  hypothetical protein  31.58 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4300  hypothetical protein  35.21 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0691  HLIP; single helix LHC light protein  45 
 
 
58 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000595991  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0672  CAB/ELIP/HLIP-related protein  45 
 
 
58 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2720  CAB/ELIP/HLIP-related protein  47.62 
 
 
54 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556008  hitchhiker  0.0000310202 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16621  putative high light inducible protein  48.65 
 
 
50 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0646927  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16861  putative high light inducible protein  48.65 
 
 
50 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16731  putative high light inducible protein  48.65 
 
 
50 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1575  putative high light inducible protein  48.65 
 
 
50 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2542  hypothetical protein  32.69 
 
 
70 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1013  putative high light inducible protein  28 
 
 
50 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  40.43 
 
 
55 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.941002  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1980  CAB/ELIP/HLIP superfamily  46.34 
 
 
46 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.741013 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18831  putative high light inducible protein  28 
 
 
50 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1000  high light inducible protein  46.51 
 
 
45 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.282827  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2916  high light inducible protein  45.71 
 
 
72 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000194255  normal  0.0166899 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04401  putative high light inducible protein  32 
 
 
50 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1790  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  48.48 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.45379  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0847  CAB/ELIP/HLIP family protein  42.22 
 
 
47 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2064  hypothetical protein  28.3 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0330706  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0874  high intensity light-inducible lhc-like protein  42.22 
 
 
47 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15031  high light inducible protein  43.28 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16041  putative high light inducible protein  34.15 
 
 
50 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0716  ferrochelatase  44.44 
 
 
391 aa  40  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>