52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1759 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1759  CAB/ELIP/HLIP-related protein  100 
 
 		 67 aa  138  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3583  CAB/ELIP/HLIP-like protein  52.73 
 
 		 56 aa  72  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0175  CAB/ELIP/HLIP-related protein  52.73 
 
 		 56 aa  71.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000121153  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1910  CAB/ELIP/HLIP-related protein  56.36 
 
 		 56 aa  68.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0846233  normal  0.275472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2057  CAB/ELIP/HLIP-related protein  52.94 
 
 		 59 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519028 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04401  putative high light inducible protein  54 
 
 		 50 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0691  HLIP; single helix LHC light protein  50.98 
 
 		 58 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000595991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0672  CAB/ELIP/HLIP-related protein  50.98 
 
 		 58 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2720  CAB/ELIP/HLIP-related protein  54.72 
 
 		 54 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556008  hitchhiker  0.0000310202 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2064  hypothetical protein  51.85 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0330706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0155  hypothetical protein  56 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0608  putative high light inducible protein  50 
 
 		 50 aa  57  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131116  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2542  hypothetical protein  54 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16041  putative high light inducible protein  47.92 
 
 		 50 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16731  putative high light inducible protein  44 
 
 		 50 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16861  putative high light inducible protein  44 
 
 		 50 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16621  putative high light inducible protein  44 
 
 		 50 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0646927  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0066  high light inducible protein-like  33.33 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1575  putative high light inducible protein  44 
 
 		 50 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1013  putative high light inducible protein  38 
 
 		 50 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18831  putative high light inducible protein  38 
 
 		 50 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4300  hypothetical protein  58.97 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2265  high light inducible protein  44.44 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.594666 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00721  high light inducible protein  43.18 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.624875 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00751  high light inducible protein  40 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1411  high light inducible protein  41.51 
 
 		 59 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  48.78 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2916  high light inducible protein  48 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000194255  normal  0.0166899 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00731  high light inducible protein  30.16 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03161  high light inducible protein  40.91 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.906124 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1282  hypothetical protein  44 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01281  high light inducible protein  29.69 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0214149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1997  high light-inducible protein  46 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3554  high light inducible protein  36.54 
 
 		 59 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  48 
 
 		 55 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.941002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4043  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  52.17 
 
 		 47 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1000  high light inducible protein  46.51 
 
 		 45 aa  44.3  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.282827  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1966  CAB/ELIP/HLIP family protein  48.89 
 
 		 47 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123276  normal  0.112404 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0368  high light inducible protein  53.49 
 
 		 46 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22638  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0874  high intensity light-inducible lhc-like protein  47.83 
 
 		 47 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0847  CAB/ELIP/HLIP family protein  47.83 
 
 		 47 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0415  high light inducible protein  42.5 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2818  high light inducible protein  40 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112403  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0243  high light inducible polypeptide HliC  45.65 
 
 		 47 aa  42.7  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.331677  normal  0.425613 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5010  high light inducible protein  44 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2323  high light inducible protein  51.16 
 
 		 46 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.647377 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00761  high light inducible protein  35.56 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1831  high light inducible protein  46 
 
 		 83 aa  41.2  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1574  ferrochelatase  50 
 
 		 388 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02401  hypothetical protein  45.45 
 
 		 48 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0824  high light inducible protein  44 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1980  CAB/ELIP/HLIP superfamily  40 
 
 		 46 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.741013 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>