59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0243 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0243  high light inducible polypeptide HliC  100 
 
 		 47 aa  92.8  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.331677  normal  0.425613 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1966  CAB/ELIP/HLIP family protein  76.6 
 
 		 47 aa  77.4  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123276  normal  0.112404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4043  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  72.34 
 
 		 47 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0874  high intensity light-inducible lhc-like protein  68.09 
 
 		 47 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0847  CAB/ELIP/HLIP family protein  68.09 
 
 		 47 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2576  hypothetical protein  76.19 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.783641  normal  0.106998 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0368  high light inducible protein  77.27 
 
 		 46 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22638  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2323  high light inducible protein  77.27 
 
 		 46 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.647377 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1000  high light inducible protein  72.09 
 
 		 45 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.282827  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02401  hypothetical protein  68.89 
 
 		 48 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01091  high light inducible protein  62.22 
 
 		 48 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.401748  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01051  high light inducible protein  63.83 
 
 		 48 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.127932  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0097  high light inducible protein-like  62.22 
 
 		 48 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.108221  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01041  high light inducible protein  72.5 
 
 		 48 aa  63.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01081  high light inducible protein  60 
 
 		 48 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1459  high light inducible protein  65.85 
 
 		 48 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01611  high light inducible protein  65.85 
 
 		 48 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1120  hypothetical protein  58.82 
 
 		 51 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1980  CAB/ELIP/HLIP superfamily  62.5 
 
 		 46 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.741013 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0691  HLIP; single helix LHC light protein  58.14 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000595991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0672  CAB/ELIP/HLIP-related protein  58.14 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  65 
 
 		 55 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.941002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1574  ferrochelatase  54.55 
 
 		 388 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1910  CAB/ELIP/HLIP-related protein  60.98 
 
 		 56 aa  51.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0846233  normal  0.275472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2720  CAB/ELIP/HLIP-related protein  60.98 
 
 		 54 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556008  hitchhiker  0.0000310202 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2057  CAB/ELIP/HLIP-related protein  55.81 
 
 		 59 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2916  high light inducible protein  56.1 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000194255  normal  0.0166899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1411  high light inducible protein  50 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2167  ferrochelatase  51.11 
 
 		 387 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.261467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0327  ferrochelatase  48.89 
 
 		 387 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0155  hypothetical protein  53.85 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0320  ferrochelatase  48.89 
 
 		 387 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2095  ferrochelatase  46.67 
 
 		 387 aa  47.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0137  ferrochelatase  51.11 
 
 		 387 aa  47.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746072  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2818  high light inducible protein  56.1 
 
 		 59 aa  47.4  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112403  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1282  hypothetical protein  53.33 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0175  CAB/ELIP/HLIP-related protein  51.16 
 
 		 56 aa  47  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000121153  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3583  CAB/ELIP/HLIP-like protein  48.84 
 
 		 56 aa  47  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5010  high light inducible protein  56.1 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3554  high light inducible protein  47.83 
 
 		 59 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1756  high light inducible protein  74.19 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.540799  normal  0.134694 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4313  ferrochelatase  51.11 
 
 		 387 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2542  hypothetical protein  55 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1331  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  43.48 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4300  hypothetical protein  56.1 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0716  ferrochelatase  46.67 
 
 		 391 aa  44.3  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2568  putative high light inducible protein  63.64 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.977203 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07661  ferrochelatase  44.44 
 
 		 391 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0342613 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1643  ferrochelatase  44.44 
 
 		 391 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1759  CAB/ELIP/HLIP-related protein  45.65 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1997  high light-inducible protein  50 
 
 		 72 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0415  high light inducible protein  50 
 
 		 69 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2222  putative high light inducible protein  62.5 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05811  ferrochelatase  42.22 
 
 		 391 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0862606  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05821  ferrochelatase  46.67 
 
 		 391 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05511  ferrochelatase  42.22 
 
 		 391 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05891  ferrochelatase  40 
 
 		 391 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.979598  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0525  ferrochelatase  42.22 
 
 		 391 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.703212  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1857  ferrochelatase  46.67 
 
 		 391 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.89761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>