23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2568 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2568  putative high light inducible protein  100 
 
 		 78 aa  163  6.9999999999999995e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.977203 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2222  putative high light inducible protein  82.05 
 
 		 78 aa  140  6e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1756  high light inducible protein  53.33 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.540799  normal  0.134694 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1120  hypothetical protein  64.71 
 
 		 51 aa  50.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2323  high light inducible protein  73.53 
 
 		 46 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.647377 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0874  high intensity light-inducible lhc-like protein  63.64 
 
 		 47 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1000  high light inducible protein  64.71 
 
 		 45 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.282827  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0847  CAB/ELIP/HLIP family protein  63.64 
 
 		 47 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1966  CAB/ELIP/HLIP family protein  69.7 
 
 		 47 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123276  normal  0.112404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4043  CAB/ELIP/HLIP superfamily protein  69.7 
 
 		 47 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0368  high light inducible protein  70.59 
 
 		 46 aa  44.3  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22638  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02401  hypothetical protein  61.76 
 
 		 48 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0243  high light inducible polypeptide HliC  63.64 
 
 		 47 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.331677  normal  0.425613 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2576  hypothetical protein  61.76 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.783641  normal  0.106998 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1459  high light inducible protein  61.76 
 
 		 48 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01611  high light inducible protein  61.76 
 
 		 48 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01041  high light inducible protein  56.76 
 
 		 48 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01081  high light inducible protein  58.82 
 
 		 48 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0672  CAB/ELIP/HLIP-related protein  54.55 
 
 		 58 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0691  HLIP; single helix LHC light protein  54.55 
 
 		 58 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000595991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01091  high light inducible protein  58.82 
 
 		 48 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.401748  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01051  high light inducible protein  58.82 
 
 		 48 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.127932  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0097  high light inducible protein-like  58.82 
 
 		 48 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.108221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>