More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1039 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1039  helicase domain protein  100 
 
 		 663 aa  1340    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.71 
 
 		 681 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.58 
 
 		 779 aa  411  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.34 
 
 		 786 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.97 
 
 		 689 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.99 
 
 		 763 aa  402  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.14 
 
 		 779 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.19 
 
 		 694 aa  394  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.01 
 
 		 679 aa  392  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.25 
 
 		 818 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.96 
 
 		 815 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.96 
 
 		 772 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0034  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.2 
 
 		 773 aa  386  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189216  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.76 
 
 		 680 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.23 
 
 		 776 aa  383  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.28 
 
 		 682 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.12 
 
 		 682 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000501886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.83 
 
 		 682 aa  385  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  0.00000000161574 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.28 
 
 		 682 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.66 
 
 		 772 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.2 
 
 		 818 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.13 
 
 		 689 aa  385  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.28 
 
 		 682 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.97 
 
 		 805 aa  383  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1984  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.31 
 
 		 690 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3954  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.43 
 
 		 682 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156287  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.99 
 
 		 781 aa  383  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0793  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.41 
 
 		 682 aa  382  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.12 
 
 		 682 aa  382  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.25 
 
 		 683 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.12 
 
 		 682 aa  382  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1286  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.09 
 
 		 686 aa  381  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.46 
 
 		 818 aa  382  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.53 
 
 		 685 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3678  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.3 
 
 		 685 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.34 
 
 		 682 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1311  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.09 
 
 		 686 aa  381  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.95 
 
 		 682 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.74 
 
 		 817 aa  378  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.27 
 
 		 818 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0198  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.66 
 
 		 691 aa  377  1e-103  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.75 
 
 		 688 aa  378  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3596  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.39 
 
 		 657 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.31 
 
 		 700 aa  372  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.15 
 
 		 812 aa  373  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  33.53 
 
 		 818 aa  373  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.38 
 
 		 740 aa  371  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.03 
 
 		 822 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.17 
 
 		 717 aa  372  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1330  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.26 
 
 		 678 aa  372  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.76 
 
 		 681 aa  370  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0449  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.15 
 
 		 676 aa  372  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0217624  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.2 
 
 		 685 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.19 
 
 		 819 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2890  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.5 
 
 		 678 aa  368  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000445621  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.19 
 
 		 819 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.8 
 
 		 707 aa  369  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.61 
 
 		 818 aa  365  1e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2579  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.76 
 
 		 678 aa  364  3e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0922078  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0536  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.58 
 
 		 676 aa  362  8e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.98 
 
 		 765 aa  361  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1105  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.04 
 
 		 799 aa  360  5e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.2 
 
 		 827 aa  360  5e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.62 
 
 		 712 aa  358  9.999999999999999e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.82 
 
 		 778 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.18 
 
 		 702 aa  357  5e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.13 
 
 		 704 aa  356  6.999999999999999e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.96 
 
 		 787 aa  356  7.999999999999999e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.17 
 
 		 691 aa  356  7.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1162  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.42 
 
 		 678 aa  356  1e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000110827  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.97 
 
 		 686 aa  355  1e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3682  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.05 
 
 		 696 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.54 
 
 		 686 aa  353  4e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.14 
 
 		 862 aa  353  8e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.46 
 
 		 815 aa  352  8.999999999999999e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.81 
 
 		 706 aa  352  1e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.07 
 
 		 701 aa  352  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0594  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.06 
 
 		 686 aa  352  2e-95  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.2 
 
 		 671 aa  352  2e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.8 
 
 		 698 aa  351  3e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.38 
 
 		 846 aa  351  3e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1702  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.41 
 
 		 564 aa  350  4e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.37 
 
 		 829 aa  350  4e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1967  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.31 
 
 		 682 aa  350  6e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.79 
 
 		 753 aa  350  7e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.99 
 
 		 846 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.98 
 
 		 690 aa  348  2e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.18 
 
 		 706 aa  347  3e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.99 
 
 		 767 aa  348  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0771  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.01 
 
 		 679 aa  347  4e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000386747 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.8 
 
 		 690 aa  347  6e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 		 720 aa  345  2e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.82 
 
 		 697 aa  344  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.06 
 
 		 695 aa  344  2.9999999999999997e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.74 
 
 		 683 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.55 
 
 		 706 aa  343  8e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2503  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.81 
 
 		 700 aa  343  8e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.623003  normal  0.0718914 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.39 
 
 		 827 aa  343  8e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1510  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.39 
 
 		 696 aa  342  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308566  normal  0.659552 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.48 
 
 		 822 aa  340  4e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>