More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1297 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1297  ATP synthase F1, epsilon subunit  100 
 
 
140 aa  285  1e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.795308 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2326  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.74 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.701275  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2023  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.94 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1046  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.59 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.100266 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.95 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.17 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929878  normal  0.384385 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0194  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.61 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0438169  normal  0.0198607 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1466  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.22 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.41 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.711596  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4461  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.78 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000884862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6634  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.81 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0501397 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1465  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.35 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.0599102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1742  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.35 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18853  normal  0.13478 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1532  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3457  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.23 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3058  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.24 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7379  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.54 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308596  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3386  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.17 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4195  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.08 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0009  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.08 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16181  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.7 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2297  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.46 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2529  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4201  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.24 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.110385  normal  0.374799 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4227  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.24 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4175  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.24 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.295254  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0810  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.84 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.116067  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12040  ATP synthase, F1 epsilon subunit  32.09 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6913  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.74 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4258  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.78 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0602  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.11 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1463  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.11 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.277241 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03615  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.78 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.901981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4236  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.78 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4195  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.78 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0063  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.93 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4074  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.78 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69427  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5167  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.78 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0939649 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.78 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002031  ATP synthase epsilon chain  33.04 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4263  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.78 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  0.317947 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4145  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.78 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4246  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.78 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.014203  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.78 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4548  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.63 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4254  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.78 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0874  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.78 
 
 
135 aa  62  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03559  hypothetical protein  36.78 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.772502  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0344  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.28 
 
 
133 aa  62  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0213495 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4099  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.78 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.420004 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.04 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3874  ATP synthase F1, epsilon subunit  36 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3729  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.03 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5017  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.2 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3283  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.79 
 
 
141 aa  60.8  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1695  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.81 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.17 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3994  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.05 
 
 
140 aa  60.5  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.305683  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1742  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  42.11 
 
 
141 aa  60.1  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.340723 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3367  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.68 
 
 
142 aa  60.1  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2796  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.5 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.63 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0273  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.43 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.16135  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16411  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.46 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.662603  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.78 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4133  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.96 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490759  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4897  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.271639 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2921  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3965  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.78 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000264026  normal  0.273139 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3510  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.38 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1938  ATP synthase F1 subuint epsilon  27.64 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.787383  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.38 
 
 
142 aa  58.2  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0052877  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.01 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.36 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.01 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.01 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.01 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.01 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.01 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.01 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0864  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.47 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0100749  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3219  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.67 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816212  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3073  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  39.08 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05011  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.41 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3302  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.46 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4294  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.474087  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3924  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.5 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0244651 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.5 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.821379  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4129  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.5 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.734658  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3307  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.01 
 
 
141 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3643  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.82 
 
 
141 aa  57  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0268699  normal  0.0255612 
 
 
-
 
NC_002936  DET0565  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.79 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1106  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.68 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4239  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.43 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.785039  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0434  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.53 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.639575  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4485  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.24 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.541695  hitchhiker  0.00000768605 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.01 
 
 
141 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4603  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.63 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359837  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5412  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.25 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.782662 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2800  ATP synthase F1, epsilon subunit  26.5 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.694074  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>