More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5094 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5094  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
304 aa  584  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27230  exopolyphosphatase  54.17 
 
 
316 aa  258  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104101  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2012  Ppx/GppA phosphatase  46.53 
 
 
311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00114972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3146  exopolyphosphatase, putative  43.42 
 
 
310 aa  215  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236338  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0475  Ppx/GppA phosphatase  43.61 
 
 
311 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8357  Ppx/GppA phosphatase  42.05 
 
 
309 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24540  Ppx/GppA phosphatase  43.81 
 
 
314 aa  207  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485932  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02700  exopolyphosphatase  42.38 
 
 
323 aa  203  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0609  Ppx/GppA phosphatase  46.15 
 
 
326 aa  203  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91513  normal  0.0958976 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10505  hypothetical protein  42.24 
 
 
344 aa  196  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0443339  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0472  Ppx/GppA phosphatase  41.45 
 
 
311 aa  191  9e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0999  Ppx/GppA phosphatase  41.39 
 
 
324 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0833  Ppx/GppA phosphatase  40.07 
 
 
355 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0398772  normal  0.792833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6144  Ppx/GppA phosphatase  41.72 
 
 
322 aa  189  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0664  Ppx/GppA phosphatase  41.25 
 
 
359 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0657  Ppx/GppA phosphatase  41.25 
 
 
359 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0677  Ppx/GppA phosphatase  41.25 
 
 
359 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0079  Ppx/GppA phosphatase  40.07 
 
 
343 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18070  Ppx/GppA phosphatase  40.07 
 
 
340 aa  186  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6748  Ppx/GppA phosphatase  42.05 
 
 
339 aa  186  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.740165  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0656  Ppx/GppA phosphatase  39.33 
 
 
319 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3147  Ppx/GppA phosphatase  40.4 
 
 
329 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.75368 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0406  Ppx/GppA phosphatase  40.2 
 
 
314 aa  176  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3352  Ppx/GppA phosphatase  40.07 
 
 
348 aa  177  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.446334  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0339  Ppx/GppA phosphatase  40.52 
 
 
314 aa  176  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3233  Ppx/GppA phosphatase  41.86 
 
 
308 aa  175  9e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1920  exopolyphosphatase  37.95 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4595  Ppx/GppA phosphatase  40.39 
 
 
320 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  29.7 
 
 
502 aa  122  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  28.25 
 
 
550 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  26.82 
 
 
305 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1456  Ppx/GppA phosphatase  29.22 
 
 
553 aa  106  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.240113 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  28.52 
 
 
570 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1244  Ppx/GppA phosphatase  32.26 
 
 
534 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.199997  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2207  Ppx/GppA phosphatase  22.74 
 
 
297 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  30.41 
 
 
307 aa  99.8  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  25.64 
 
 
545 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  25.64 
 
 
545 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  30.65 
 
 
549 aa  97.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  26.69 
 
 
557 aa  97.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  27.78 
 
 
544 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1198  Ppx/GppA phosphatase  27 
 
 
549 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0454  Ppx/GppA phosphatase  25.88 
 
 
521 aa  94.4  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  24.84 
 
 
550 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1828  Ppx/GppA phosphatase  28.22 
 
 
304 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.707842  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  31.91 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1006  Ppx/GppA phosphatase  32.37 
 
 
524 aa  89.7  6e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0238  Ppx/GppA phosphatase  22.79 
 
 
300 aa  89.4  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.218725  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  26.73 
 
 
523 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  25.08 
 
 
519 aa  87  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0489  Ppx/GppA phosphatase  23.58 
 
 
527 aa  86.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2137  Ppx/GppA phosphatase  24.24 
 
 
303 aa  85.9  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00893545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2154  Ppx/GppA phosphatase  26.19 
 
 
300 aa  85.5  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  23.55 
 
 
519 aa  85.1  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  24.28 
 
 
531 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  25.25 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  25.57 
 
 
544 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2062  Ppx/GppA phosphatase  31.84 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  27.27 
 
 
491 aa  84.3  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  25.57 
 
 
544 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2422  Ppx/GppA phosphatase  25.81 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3684  Ppx/GppA phosphatase  24.92 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131918  normal  0.207206 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0693  Ppx/GppA phosphatase  33.44 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195152  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2046  exopolyphosphatase  26.29 
 
 
510 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.941152  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0423  exopolyphosphatase, putative  24.01 
 
 
519 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2062  exopolyphosphatase, putative  25.66 
 
 
312 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0692  Ppx/GppA phosphatase  32.8 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.224479  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1684  exopolyphosphatase, putative  25.65 
 
 
514 aa  79  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3926  Ppx/GppA phosphatase  23.7 
 
 
311 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  23.67 
 
 
507 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  28.38 
 
 
520 aa  77.8  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0232  Ppx/GppA phosphatase  30.03 
 
 
498 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2326  Ppx/GppA phosphatase  29 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.964063  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0498  Ppx/GppA phosphatase  24.67 
 
 
521 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0316  exopolyphosphatase  22.67 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  26.81 
 
 
532 aa  76.3  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  28.52 
 
 
502 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0096  Ppx/GppA phosphatase  23.96 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  28.52 
 
 
505 aa  75.5  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2542  Ppx/GppA phosphatase  28.57 
 
 
533 aa  75.5  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  23.25 
 
 
531 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  23.32 
 
 
531 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  22.37 
 
 
506 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  29.87 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  25.87 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  27 
 
 
505 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  26.4 
 
 
497 aa  73.2  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1279  Ppx/GppA phosphatase  27.51 
 
 
504 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223089  normal  0.967623 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  22.93 
 
 
531 aa  72.8  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  26.45 
 
 
513 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0827  Ppx/GppA phosphatase  27.51 
 
 
504 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1308  Ppx/GppA phosphatase  27.51 
 
 
504 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.56704  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4451  Ppx/GppA phosphatase  27.51 
 
 
504 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.966825  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  23.83 
 
 
502 aa  72.4  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  22.55 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2012  Ppx/GppA phosphatase  27.51 
 
 
504 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2821  Ppx/GppA phosphatase  22.7 
 
 
312 aa  72  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1627  exopolyphosphatase  27.88 
 
 
504 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2765  exopolyphosphatase  27.88 
 
 
504 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316469  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0569  exopolyphosphatase  27.88 
 
 
504 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.769517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>