More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0489 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1684  exopolyphosphatase, putative  66.54 
 
 
514 aa  689    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0423  exopolyphosphatase, putative  63.64 
 
 
519 aa  684    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1993  Ppx/GppA phosphatase  68.02 
 
 
519 aa  722    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0498  Ppx/GppA phosphatase  66.99 
 
 
521 aa  705    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0454  Ppx/GppA phosphatase  68.92 
 
 
521 aa  732    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  63.39 
 
 
519 aa  685    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0489  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
527 aa  1076    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1244  Ppx/GppA phosphatase  40.43 
 
 
534 aa  369  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.199997  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  35.85 
 
 
550 aa  283  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  35.94 
 
 
545 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  35.94 
 
 
545 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  32.95 
 
 
544 aa  272  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1198  Ppx/GppA phosphatase  32.62 
 
 
549 aa  271  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1456  Ppx/GppA phosphatase  33.66 
 
 
553 aa  269  8e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.240113 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  33.61 
 
 
531 aa  266  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  35.29 
 
 
549 aa  266  8e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  33.14 
 
 
570 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  33.61 
 
 
531 aa  263  8e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  36.42 
 
 
550 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  33.07 
 
 
531 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  31.24 
 
 
532 aa  258  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  33.4 
 
 
531 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  31.8 
 
 
539 aa  257  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  32.52 
 
 
545 aa  253  6e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  31.63 
 
 
513 aa  253  9.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  34.6 
 
 
544 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  34 
 
 
544 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  31.16 
 
 
513 aa  251  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  32.24 
 
 
523 aa  248  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  34.54 
 
 
557 aa  247  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  32.81 
 
 
548 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  31.18 
 
 
513 aa  240  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  29.9 
 
 
505 aa  240  5e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  32.94 
 
 
519 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  30.91 
 
 
519 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  30.77 
 
 
502 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  30.92 
 
 
501 aa  219  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  26.67 
 
 
505 aa  214  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  30.99 
 
 
510 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3517  Ppx/GppA phosphatase  29.24 
 
 
508 aa  211  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.380715  normal  0.228242 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  31.67 
 
 
511 aa  210  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0574  Ppx/GppA phosphatase  30.65 
 
 
511 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289083  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  30.35 
 
 
500 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  29.71 
 
 
507 aa  206  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  29.34 
 
 
500 aa  203  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  30.23 
 
 
506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  29.67 
 
 
520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2106  Ppx/GppA phosphatase  27.18 
 
 
510 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000089745  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  29.93 
 
 
501 aa  185  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2413  Ppx/GppA phosphatase  30.84 
 
 
501 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.58803  hitchhiker  0.0004512 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  31.09 
 
 
501 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  29.17 
 
 
502 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  30.5 
 
 
500 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  30.5 
 
 
500 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  30.23 
 
 
519 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  30.23 
 
 
519 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0256  exopolyphosphatase  30.02 
 
 
500 aa  181  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  28.13 
 
 
526 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  28.13 
 
 
526 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  28.13 
 
 
526 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  28.13 
 
 
526 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  28.13 
 
 
513 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  30 
 
 
519 aa  179  7e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  30.05 
 
 
500 aa  180  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  28.93 
 
 
513 aa  179  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  27.11 
 
 
501 aa  179  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  29.43 
 
 
500 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2765  exopolyphosphatase  32.84 
 
 
504 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316469  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2876  exopolyphosphatase  29.16 
 
 
513 aa  178  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0096  Ppx/GppA phosphatase  35.1 
 
 
306 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  30.88 
 
 
508 aa  177  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  29.91 
 
 
509 aa  177  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  30.77 
 
 
506 aa  177  4e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000012733 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2278  Ppx/GppA phosphatase  31.12 
 
 
499 aa  177  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0789  exopolyphosphatase  32.35 
 
 
504 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1627  exopolyphosphatase  32.35 
 
 
504 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0583  exopolyphosphatase  32.35 
 
 
504 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1524  Ppx/GppA phosphatase family protein  32.35 
 
 
504 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1493  Ppx/GppA phosphatase family protein  32.35 
 
 
504 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0569  exopolyphosphatase  32.35 
 
 
504 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.769517  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1301  exopolyphosphatase  32.35 
 
 
504 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02394  exopolyphosphatase  28.93 
 
 
513 aa  177  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.708213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1167  Ppx/GppA phosphatase  28.93 
 
 
513 aa  177  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1174  exopolyphosphatase  28.93 
 
 
513 aa  177  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0153917 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02356  hypothetical protein  28.93 
 
 
513 aa  177  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2650  exopolyphosphatase  28.93 
 
 
513 aa  177  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2785  exopolyphosphatase  28.93 
 
 
513 aa  177  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.887367  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3725  exopolyphosphatase  28.93 
 
 
513 aa  177  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.282301  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  29.11 
 
 
511 aa  176  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2012  Ppx/GppA phosphatase  32.6 
 
 
504 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1185  Ppx/GppA phosphatase  32.85 
 
 
504 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2159  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  28.95 
 
 
510 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.990751  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2637  exopolyphosphatase  28.93 
 
 
513 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.448662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1197  Ppx/GppA phosphatase  32.85 
 
 
504 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  28.29 
 
 
497 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  29.25 
 
 
511 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01029  exopolyphosphatase  30.39 
 
 
501 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0162  exopolyphosphatase  30.88 
 
 
508 aa  172  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000221963 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  29.65 
 
 
505 aa  171  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  28.97 
 
 
500 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>