More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0609 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0609  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
326 aa  617  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91513  normal  0.0958976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8357  Ppx/GppA phosphatase  64.4 
 
 
309 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2012  Ppx/GppA phosphatase  63.52 
 
 
311 aa  361  9e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00114972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3146  exopolyphosphatase, putative  62.21 
 
 
310 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236338  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0475  Ppx/GppA phosphatase  61.24 
 
 
311 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24540  Ppx/GppA phosphatase  59.93 
 
 
314 aa  330  2e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485932  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0472  Ppx/GppA phosphatase  58.71 
 
 
311 aa  326  4.0000000000000003e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6748  Ppx/GppA phosphatase  58.12 
 
 
339 aa  318  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.740165  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18070  Ppx/GppA phosphatase  54.4 
 
 
340 aa  317  2e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6144  Ppx/GppA phosphatase  59.03 
 
 
322 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10505  hypothetical protein  56.21 
 
 
344 aa  311  9e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0443339  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0656  Ppx/GppA phosphatase  55.41 
 
 
319 aa  309  4e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.302844  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0999  Ppx/GppA phosphatase  55.41 
 
 
324 aa  306  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0657  Ppx/GppA phosphatase  55.88 
 
 
359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0664  Ppx/GppA phosphatase  55.88 
 
 
359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0677  Ppx/GppA phosphatase  55.88 
 
 
359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0079  Ppx/GppA phosphatase  54.25 
 
 
343 aa  305  6e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0339  Ppx/GppA phosphatase  58.28 
 
 
314 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3147  Ppx/GppA phosphatase  55.37 
 
 
329 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.75368 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3352  Ppx/GppA phosphatase  54.4 
 
 
348 aa  302  7.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.446334  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0406  Ppx/GppA phosphatase  57.69 
 
 
314 aa  301  9e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0833  Ppx/GppA phosphatase  54.25 
 
 
355 aa  297  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0398772  normal  0.792833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02700  exopolyphosphatase  53.38 
 
 
323 aa  295  5e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1920  exopolyphosphatase  47.88 
 
 
322 aa  285  5.999999999999999e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4595  Ppx/GppA phosphatase  53.38 
 
 
320 aa  271  8.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3233  Ppx/GppA phosphatase  51.96 
 
 
308 aa  259  3e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5094  Ppx/GppA phosphatase  46.15 
 
 
304 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27230  exopolyphosphatase  41.12 
 
 
316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104101  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1244  Ppx/GppA phosphatase  32.48 
 
 
534 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.199997  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  31.29 
 
 
570 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  30.84 
 
 
550 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  31.49 
 
 
513 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  30.29 
 
 
502 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  30.27 
 
 
550 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  32.03 
 
 
502 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  30.92 
 
 
510 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  30.59 
 
 
511 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1684  exopolyphosphatase, putative  25.97 
 
 
514 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  30.16 
 
 
549 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  28.25 
 
 
557 aa  117  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  25.16 
 
 
301 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1006  Ppx/GppA phosphatase  32.8 
 
 
524 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0423  exopolyphosphatase, putative  26.27 
 
 
519 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  29.08 
 
 
513 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0454  Ppx/GppA phosphatase  24.44 
 
 
521 aa  112  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  27.1 
 
 
545 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  27.1 
 
 
545 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  34.64 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  26.49 
 
 
519 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1456  Ppx/GppA phosphatase  29.9 
 
 
553 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.240113 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2821  Ppx/GppA phosphatase  27.69 
 
 
312 aa  110  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  28.43 
 
 
544 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  25.49 
 
 
305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  22.4 
 
 
519 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  27.12 
 
 
544 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  27.12 
 
 
544 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0498  Ppx/GppA phosphatase  23.95 
 
 
521 aa  105  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  30.07 
 
 
505 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1993  Ppx/GppA phosphatase  23.05 
 
 
519 aa  103  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1158  Ppx/GppA phosphatase  31.61 
 
 
503 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.776682  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  28.52 
 
 
501 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1441  exopolyphosphatase  31.61 
 
 
503 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  32.57 
 
 
505 aa  102  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  30.55 
 
 
513 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  26.73 
 
 
523 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  24.68 
 
 
531 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  32.79 
 
 
520 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  31.17 
 
 
545 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  28.62 
 
 
539 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  28.43 
 
 
501 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  25.62 
 
 
531 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0489  Ppx/GppA phosphatase  22.43 
 
 
527 aa  97.1  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  25.83 
 
 
531 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  28.95 
 
 
500 aa  96.3  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  28.38 
 
 
548 aa  95.9  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1198  Ppx/GppA phosphatase  25.58 
 
 
549 aa  96.3  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2448  Ppx/GppA phosphatase  25.9 
 
 
311 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  23.31 
 
 
506 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  26.54 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  28.34 
 
 
532 aa  94  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  30.03 
 
 
310 aa  93.6  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0316  exopolyphosphatase  23.95 
 
 
314 aa  93.6  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2326  Ppx/GppA phosphatase  33.65 
 
 
304 aa  92.8  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.964063  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  25.63 
 
 
531 aa  92.8  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  26.58 
 
 
519 aa  92  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  29.81 
 
 
355 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0575  Ppx/GppA phosphatase  28.9 
 
 
327 aa  91.3  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.881206  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2422  Ppx/GppA phosphatase  27.65 
 
 
311 aa  90.9  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  28.95 
 
 
500 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2062  exopolyphosphatase, putative  28.25 
 
 
312 aa  90.5  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2753  Ppx/GppA phosphatase  30.28 
 
 
363 aa  90.5  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363903  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1851  Ppx/GppA phosphatase  27.3 
 
 
311 aa  89.7  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210768  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3926  Ppx/GppA phosphatase  26.45 
 
 
311 aa  89  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2076  Ppx/GppA phosphatase  27.39 
 
 
294 aa  89  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2046  exopolyphosphatase  22.22 
 
 
510 aa  89  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.941152  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0022  Ppx/GppA phosphatase  24 
 
 
321 aa  88.2  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2586  Ppx/GppA phosphatase  25.4 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.495242  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1303  Ppx/GppA phosphatase  27.08 
 
 
513 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1593  Ppx/GppA phosphatase  27.08 
 
 
513 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.229117  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2180  Ppx/GppA phosphatase  24.68 
 
 
317 aa  87.8  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>